我个人认为不是很冲突。
考研英语虽然和六级有差异（考研重深度，六级重广度），但毕竟都是英语考试有相通点的，因此，同时进行二者的复习不会有冲突的。
我建议你词汇书直接用考研的书，你只要对比一下就可以发现考研的词汇是涵盖了六级的词汇的。有一点需要注意的是，考研的词汇广度不如六级的大，但是考研的词汇讲究一个深度，一个很常见的单词需要你准确地知道它在不同语境下的多个意思，
要在英语考试里拿高分，阅读是重中之重。考研考查阅读是精读，而六级考试注重快速阅读，因此在做阅读时就不要用考研的阅读来做六级的阅读训练。以真题为蓝本进行，研究真题的命题思路对于顺利通过考试会有帮助的。
至于作文方面直接准备六级作文，在此同时也就为考研的小作文打基础了。
还有一点很重要，就是听力，一定要多听多练！如果基础不错，那么多听听英文广播节目，问题不大，如果基础不好，最好就是以六级真题的听力做练习。因为，尽管在考研初试中不考听力，但是在复试中也会考听力的，你现在打好了听力基础，那么等待考研复试时你就不用花太多时间在这上面了（考研英语听力试题的难度在六级英语左右）。
综上，建议你以复习六级为主，兼顾考研，提前打好考研词汇的基础。多做两者的真题，培养思路和语感。
个人意见，仅供参考！
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