合并工作底稿的作用是为合并财务报表的编制提供基础。在合并工作底稿中，对母公司和子公司的个别财务报表各项目的金额进行汇总和抵销处理，最终计算得出合并财务报表各项目的合并金额。
从税收角度出发，价格要公允；会计上也有要求，只是合并报表抵消两者的交易，对于合并报表没有影响。对于一般企业来说，租金是其他业务收入；对于以物业租赁等为主业的公司，就是主营收入。如果属于以前年度的，要调整以前年度利润。
没有开具发票的，可以不开具了，但收入，要补做，即使补开了发票，母公司所得税也不可能调整不了，具体需要根据公司情况，与主管税务部门沟通。
在编制合并财务报表前：
母公司应当统一子公司所采用的会计政策，使子公司采用的会计政策与母公司保持一致。子公司所采用的会计政策与母公司不一致的，应当按照母公司的会计政策对子公司财务报表进行必要的调整;或者要求子公司按照母公司的会计政策另行编报财务报表。
同时，母公司应当统一子公司的会计期间，使子公司的会计期间与母公司保持一致。子公司的会计期间与母公司不一致的，应当按照母公司的会计期间对子公司财务报表进行调整;或者要求子公司按照母公司的会计期间另行编报财务报表。
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