该校连续三届中考成绩卓著。 2004年（系该校复办以来的第一届毕业生）中考：218名学生，共有63人先期考上福州一中新校区（在全省范围招生），居全省第一名。其余155名考生参加福州市中考，总平均分（除考上福州一中新校区63人外、不含体育）达632.59，且仍有63人考上福州一中东街校区等一级达标学校，占考生总数的40.6%，名列福州市前茅。 2005届中考：200多名学生，400分（高分段）以上考生共102人，被一级达标校录取的考生共计136人（占62%），其中被福州一中录取的考生达70多人。名列福州市前茅。 2006届中考：207名学生，400分以上124人（高分率达59.9%），考上一级达标校的计有163人（占总数的78.7%），其中被福州一中录取的更是高达82人之多，比率40%为福州市绝无仅有。 2007届中考：309名学生，400分以上106人，已被一级达标校录取的共有222人，其中被福州一中录取的人数高达114人。 2008届中考：415名学生，400分以上317人，410分以上247人（全市2909人），415分以上195人（全市1966人），420分以上156人（全市1155人），430分以上32人（全市169人）。其中考入福州一中人数高达147人，被一级达标校录取334人。陈正颖同学以444.5分夺得福州市最高分（语数英三科原始分439.5，省运会乒乓球冠军加5分）。各项数据都居福州市第一。 2009年，江川同学以443.5分勇夺中考状元，为09届八班赢得荣誉。2010年，考入福州一中88人。2012年，全市总排名第二，其中考上一中人数137人，全市第一。2013年，三牧中学中考成绩500分以上的人数有168人，约占年段总人数的35%，全市总排名第一。2014年，我校学生勇夺中考状元、榜眼、探花，同时包揽了福州市中考成绩前六名，前九名中占有八席,只有第七名为福州一中初中部学生董焌锴获得。一所学校几乎包揽了全市中考的前十名在福州市是绝无仅有的，
中考成绩525分以上全市累计13人，我校有11人
中考成绩520分以上全市累计59人，我校14人；占比24%
中考成绩515分以上全市累计180人，我校35人；占比19%
我校被福州一中录取106人，人数依旧为全市之最；被福州三中录取43人；被师大附中录取28人……
