临沂市国家税务局的机构设置包含了多个职能科室，以确保高效有序的税收管理和公共服务。以下是主要科室职责的概述：
办公室：负责制定年度工作计划和长远发展规划，处理日常政务，包括文件起草、审核，会议组织，秘书事务，文电处理，以及文印、信访、保密、调研、政务信息、税收宣传和外事工作。此外，还负责目标管理考核、综合行政管理信息系统管理和人大代表建议、政协委员提案的办理。
政策法规科：承担政策法规的调查研究和宣传培训，建立和推行税收执法规范，监督税收法规执行，处理税务行政诉讼和赔偿等法律事务，以及规范性文件的审核和外部监督工作。
流转税管理科：负责增值税、消费税、营业税等税种的征收管理和税政业务，确保法规执行，制定实施办法，并负责日常稽核和检查工作。
所得税管理科：负责企业所得税和储蓄存款利息所得税等税种的管理，解释和处理税政问题，制定实施办法，组织日常检查，并管理相关金融机构的财务制度。
进出口税收管理科：负责进出口税收政策的落实，出口退税审核，以及信息化管理系统的推广和维护，协同反避税检查工作。
国际税务管理科：负责国际税收协定执行、反避税、税务审计、情报交换以及跨国收益税收监管等国际税务事务。
征收管理科：实施综合性税收征管法律，管理税务登记资料，组织征管质量考核，指导个体工商户和市场税收征管，推广税控器具，打击发票违法行为，以及负责纳税评估和日常管理。
计划统计科：负责税收计划、会计、统计和数据分析，处理税款入库和退库，监控税源，管理税收票证。
财务管理科：负责系统经费、财务、建设、装备和资产管理工作，内部审计和政府采购，机关财务管理和监督。
人事教育科：执行人事管理制度，负责人员任免、考核、教育培训、思想政治工作和基层建设。
其他科室如离退休干部管理办公室、监察室、机关党委办公室、稽查局及其内部科室、信息中心和机关服务中心则分别负责相应领域的工作，如离退休干部管理、党风廉政建设、党务工作、税收检查、信息系统建设和后勤服务等。
开发区国家税务局则专注于当地税收政策的执行和纳税服务，包括税收规划、经济调控、发票管理以及进出口税收工作。
临沂市国家税务局是临沂市主管国家税收工作的行政机构，由国家税务总局实行垂直管理。临沂市国家税务局成立于1994年9月，下辖市区、罗庄、河东、郯城、苍山、莒南、沂水、蒙阴、平邑、费县、沂南、临沭12个县、区国家税务局，1个经济开发区国家税务局，1个高新技术产业园区国家税务局。