中国最好的医学院大学排名是：北京协和医学院、海军军医大学、首都医科大学、空军军医大学、北京中医药大学。
1、北京协和医学院
北京协和医学院（Peking Union Medical College），位于北京市，是国家卫生健康委员会直属、与中国医学科学院实行院校合一管理体制的全国重点大学，国家“双一流”建设高校，入选卓越医生教育培养计划、医学“双一流”建设联盟成员。
2、海军军医大学
中国人民解放军海军军医大学（The Second Military Medical University），简称海军军医大学（第二军医大学）。
该校是国家“211工程”、军队“2110工程”和原总后勤部“530工程”重点建设院校，首批国家“双一流”世界一流学科建设高校，军队研究生培养重点建设院校，是军队3所设置研究生院的单位之一。
该校是全国首批博士、硕士学位授予单位和首批开办八年制医学教育的高校，入选教育部“卓越医生教育培养计划”、国家建设高水平大学公派研究生项目、国家生命科学与技术人才培养基地、外军医学留学生培养基地。
3、首都医科大学
首都医科大学建校于1960年，是北京市重点高等院校，是北京市政府、国家卫生健康委员会、教育部共建院校。
学校校本部设有11个学院、1个研究中心，包括基础医学院、药学院、公共卫生学院、护理学院、生物医学工程学院、中医药学院、医学人文学院、全科医学与继续教育学院、马克思主义学院、国际学院、燕京医学院，脑重大疾病研究中心。
4、中国人民解放军空军军医大学
中国人民解放军空军军医大学（第四军医大学）是一所培养高、中层次医学专业人才的全国重点大学。
学校1959年被中共中央确定为全国首批20所重点大学之一，1995年进入军队重点建设院校行列，1997年成为国家首批22所“211工程”重点建设院校之一，2017年进入国家“双一流”建设首批一流学科建设院校行列。
5、北京中医药大学
北京中医药大学是一所以中医药学为主干学科的全国重点大学，直属教育部管理，由教育部、国家卫生健康委员会、国家中医药管理局和北京市共建。