二、厦门大学最好的专业是：
会计学、
金融学、
行政管理、
经济学、
财政学、
物理学、
英语、
法学、
历史学、
海洋科学、
化学、
生物科学、
统计学、
数学与应用数学、
材料科学与工程、
国际经济与贸易、
广告学。
三、东南大学最好的专业是：
建筑学、
城市规划、
机械工程及其自动化、
热能与动力工程、
信息工程、
通信工程、
土木工程、
工程管理、
电子科学与技术、
数学与应用数学、
自动化、
计算机科学与技术、
软件工程（软件工程方向）、
软件工程（网络工程方向）、
生物医学工程、
材料科学与工程、
电气工程及其自动化、
交通工程、
道路桥梁与渡河工程、
测控技术与仪器、
医学影像学。
厦门大学擅长经济管理类专业，比如金融学，经济学，国际贸易，财政学，会计学，工商管理，企业管理等，另外化学，新闻传播学，法学等也是厦门大学的优势学科，如果你是文科生，重点推荐厦门大学。
东南大学则擅长工科专业，电子科学与技术，信息与通信工程，交通运输工程，建筑学，生物医学工程，热能工程，计算机应用技术等一批专业实力相当不错，如果你喜欢以上专业，报考东南大学最好。
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一个在东南读书的厦门人激情作答
总的来说，两所学校有非常多相似的地方；学科则各有侧重，厦大文理一流，东南工科突出，总排名相近，不存在某所学校一定更好的问题。
首先名头上，二者都是985、211、世界一流大学A类高校、中央直管副部级大学；
其次，两所学校的综合排名真的很接近！！很接近！！这几年好多排名里两所学校互相领先，有时候东南略高一两名，有时厦大更前一点。
事实上，东南和厦大都是“中坚九校”——哈工大、中山、武大、华科、西交、厦大、东南、北理工、天津大学之一，代表着我国高等教育的中坚力量，各省市平均录取分数线也并没有很大差异（据我所知以前厦大略高，现在工科热门，东大分数也水涨船高）。
其他很少有人注意的共同点：
两校都在1921年获得“大学”的名称（厦大成立，东南前身国立东南大学开始招生），都是声誉卓著的百年名校；
两校校训都有“止于至善”四字（厦大校训“自强不息，止于至善”，东南校训“止于至善”。民国的厦大和国立东南大学是完全一样的“止于至善”）；
两校老校区都毗邻一座千年古刹：东南大学四牌楼校区过一条马路就是“南朝第一寺”鸡鸣寺，厦大思明校区与中国佛教高等教育发端南普陀仅一墙之隔；
两校新校区均远离市中心，偏远但是交通便利：都通有地铁三号线（东南新校区九龙湖校区在江宁开发区，厦大新校区设在翔安。九龙湖的南京地铁3号线已经通车，厦大翔安校区规划有厦门地铁3号线支线，正在进行前期工作。两校的地铁也都连接了新校区和老校区），且都与国际机场同在一个行政区（禄口机场和建设中的翔安机场）。
相同点说完了，下面是两所学校的差异：
优势学科：
厦大是传统的文理名校，东南则历来以工科著称。
厦门大学：
海，是厦大的灵魂。在游客眼中，海是如诗如画的美景，是厦大“最美大学”名头的主因；于厦大而言，则是得天独厚的海洋科研条件。厦大是我国海洋科学研究的开端，无数学界泰斗从这里走出；1923年即有研究成果发表于世界顶级期刊Science，与世界各大学均有合作关系。如今海洋专业的另一所顶尖学府中国海洋大学，就是以厦大为主要前身之一建立的，第四轮学科评估中厦大海洋学获评A+（全国前2），也是双一流建设学科，在国际上仍有广泛影响。
厦大化学系建立了我国第一个物质结构研究所、第一个催化化学教研室，中国化学会首批会员有多位厦大教授，是双一流学科。第四轮学科评估获得A（全国前7），高于南京大学、上海交大等顶尖大学，拥有几乎是我国物理化学领域的最高峰——固体表面物理化学国家重点实验室，是全国唯一历届评估全部优秀的化学化工类国重室，有6位全职院士。整个化院的全职院士仅次于北大和中科大。历史上我国两位在国际电化学学会担任领导职务的科学家，都是厦大教授。中科院前任院长、我国物理化学泰斗卢嘉锡院士在厦大学习、从教长达25年，他与其他教师一道努力，奠定了今日厦大化学崇高的学术地位。
（我在东南学线性代数的时候，老师举的唯一一个实际应用的例子，就是厦大把群论与化学相结合做出来的成果，足见厦大化学声名远扬）
生物学也是厦大强项之一，第四轮学科评估获评A-（8~16名），第三轮学科评估第11名，超过了浙大、山川吉这些老牌综合大学的生物系，有国家理科生物学基础科研基地、国家生命科学与技术人才培养基地，是基础学科拔尖学生培养试验计划（生物学）的16所高校之一，有全职院士和多个国家级中心。印象里疫苗研究尤为突出，全世界第一个戊型肝炎疫苗、第一个国产宫颈癌疫苗都是厦大的成果。
当然，名气最大的要数厦大的经管学科。无数金融大鳄、政界名流本身就是厦大经管学科的最佳代言，“艾利斯顿商学院”等影视剧中的频频亮相又为这份名气锦上添花。然而这并不是有名无实，厦大经济研究所是中国高校第一个经济学研究机构，有“中国高校第一所”的美誉；中国第一位MBA、第一位会计学博士、第一位审计学博士、第一位财政学博士也都出自厦大。学科评估中，厦大也有卓越的表现：
综合应用经济学、统计学、工商管理的排名，厦大在国内稳居第一梯队。王亚南经济研究院（WISE）更是著名的学术重镇。
此外，厦大的法学在第四轮评估中获得A-（8~14名），虽然不属于传统的“五院四系”，但在全国还是有不错的影响力，联合国贸发会议在2010年遴选国际投资法“全球15所法学院领航项目”成员，厦大法学院是大陆唯一入选的院校；全国只有9所大学法学院有资格申请杜克全球领袖奖学金（Global Leader Scholarship Program），其中也包括厦大。
上述优势学科以外，厦大的文理学科群普遍都有不错的水平，如广告学堪称中国的“黄埔军校”，人类学是全国重镇，历史有国家基地班，数学获批国家数学中心分中心，等等。
东南大学：
先来看这组数据：东南共有11个学科入选“双一流”学科，其中工学类入选学科10个，仅次于清华大学，全国第二；第四轮学科评估中，东南有5个A+学科，工学学科占4个，同样仅次于清华，全国第二。东南也是教育部直属的原“四大工学院”（华中科大、东南、大连理工、华南理工）之一。除了清华以外，东南有信心与任何一所内地高校在工科领域一较高下；清华、东南是仅有的两所在土建、弱电两大学科群都做到国内顶尖的大学。
建筑学是东南大学的门面，每一位东大学子都或多或少了解它的辉煌。正如东大建筑学院的院系代码“01”一样，毫不夸张地说，东南大学引领着全国建筑学的发展：1927年，中国第一个现代建筑学科在东南大学前身国立中央大学成立，公认的“中国建筑四杰”——梁思成、杨廷宝、童寯、刘敦桢四位大师里的后三位都曾在东大长期执教，近百年来一脉相承。建筑学“诺贝尔奖”普利兹克奖第一位中国评审、第一位中国获奖者都毕业于东大，清华、同济、天津大学等建筑学强校的领军人才也或多或少与东南有关，备受关注的雄安新区仅有清华、同济、东南三校参与其总体规划编制。东大是业内赫赫有名的“建筑老八校”之一，综合实力在老八校稳居前四，第四轮学科评估中与清华大学并列A+（全国前二）。
历史更悠久的土木工程学科源自1923年茅以升创办的国立东南大学土木工程系，为中国的近代化、现代化事业做出了巨大贡献，第四轮学科评估与同济大学并列A+（全国前二）。
东南电子科学与技术学科在第三轮学科评估中仅次于电子科技大学，全国第二；第四轮学科评估中，与清华、北大并列A（全国3~5名），是首批9个国家集成电路人才培养基地之一、首批9所国家示范性微电子学院之一，与剑桥、UCB、代尔夫特理工、早稻田、南洋理工、港科大、飞利浦、AT&T、ARM、赛灵思、德州仪器、日本松下、台积电等电子领域世界知名的院校、企业均有合作，2018年在集成电路国际最高会议ISSCC上发布了我国第一篇存储器论文，足见实力强悍。
信息学科的历史则可追溯至1923年的国立东南大学电机工程系。上世纪30年代，东大开创了我国无线电教育的先河；3G、4G、5G通信的发展中，东南大学都曾做出巨大贡献。东大通信学科与麻省理工、斯坦福、佐治亚理工、加州大学、伦敦大学、移动、联通、电信、华为、中兴、大唐、展讯、爱立信、诺基亚、高通、西门子、阿尔卡特-朗讯、韩国电子通信研究院等该领域领先的高校、企业、院所均有科研合作关系，实验室课题覆盖了国内数十个高校和研究所；12位通信学院的毕业生当选两院院士，就业率100%，2019年有近500位毕业生进入华为公司工作，人数为全国高校最前列。
基本科学指标数据库（ESI）排名是世界公认的衡量科学研究水平的重要指标，每两个月更新一次。在2019年5月的最新排名中，东南大学“计算机科学”（Computer Science，涵盖狭义的电子科学、通信科学、计算机科学等弱电类学科门）在全球近4.5万个进入数据库的大学、科研院所中高居第17位。换句话说，东南大学电子类学科属于全球前万分之四的世界顶尖水平，且仍在不断进步。细心观察这份榜单，东南大学的“顶级论文数”、“高被引论文数”更是超过清华，位列全国第一，足以说明东大电科水平之高。东南所有的3个国家重点实验室都是电类相关：移动通信、毫米波、生物电子学，其中生物电子学国重室依托的生物医学工程是我国第一个相关专业，第二、三轮学科评估均为全国第一，第四轮评估与华中科大并列A+（全国前二）。其他涉电类学科如自动化（第四轮评估A-）、仪器科学与技术（第四轮A-）、计算机（B+）、电气工程（B+）同样稳居全国前列，有悠久的学科传承。东大是名副其实的电类强校！
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