从表面上看，这个城市是令动物向往的。城市体系中，根据每个动物的身材、习性精心设置了不同种类的门、通道、房屋以及其他生活装置，处处流露出对不同个体的尊重。
但“现实世界并不像标语上说得那么美好，而是既复杂又残酷”。
完美的表层之下，“疯狂动物城”涌动着偏见的暗流。食草动物对食肉动物DNA里遗传的野蛮天性深深恐惧，觉得最好给他们都戴上嘴套；食肉动物则对食草动物的不信任心怀不满。
故事主角、乡下兔姑娘朱迪，从小到大都饱受偏见之苦。朱迪的梦想是成为历史上第一个兔子警察，但父母认为，兔子“种胡萝卜”似乎更加现实。
同镇的狐狸也嘲笑朱迪的警察梦，认为她不过是个“愚蠢的兔子”。
后来，朱迪通过努力，终于成为警察，可她还要面对种族、职场的双重偏见（这里甚至还可能包含性别偏见）——上司牛局长认为，犀牛、大象等警员更加可靠，至于一个兔子，只能去街头贴罚单。
作为偏见的受害者，朱迪在工作中努力消除动物们之间的偏见。在侦破14个动物失踪案中，朱迪还和食肉动物狐狸尼克成为搭档，建立了互信关系。

不幸的是，偏见和暴力一样，藏在人心深处。你自以为不是个有偏见的人，其实未必。
朱迪解救了城内失踪的十四个动物，成了城市英雄。在新闻发布会上，朱迪说出了作为一个食草动物所潜藏在心底的恐惧和偏见——“食肉动物会野蛮化”。
动物城内骚动了，食草动物的偏见集体爆发，食肉动物面临及其危险的处境，连好朋友狐狸尼克也不能忍受朱迪，弃她而去。
朱迪意识到自己犯下了大错，后悔不已，辞去了警察工作。
但动物失踪的背后，却隐藏着一个巨大的阴谋——原来，这些食肉动物野蛮化，都是人为——不，动物为——造成的。
看起来人畜无害、老实巴交、乐于助人的羊副市长，其实是个腹黑的阴谋家。
她先利用食肉动物野蛮化，搞掉了政敌狮子市长，又计划利用食草动物的集体偏见，形成“多数人暴政”的局面，把肉食动物统统赶出动物城，建立纯粹食草动物的乌托邦……
看着眼熟不？和当年希特勒的手法相似。
当然了，朱迪最终成功逆袭，力挽狂澜，不细说了。
羊并不像想的那么老实，兔子并不像想的那么愚蠢，狐狸也并不像想的那么狡猾。
老实、愚蠢、狡猾，很多时候是来源于你我心中的偏见。
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