会计核算程序主要有记账凭证账务处理程序、汇总记账凭证账务处理程序和科目汇总表账务处理程序。首先，记账凭证账务处理程序步骤如下：根据原始凭证编制收付款凭证、付款凭证和转账凭证，随后登记现金日记账和银行存款日记账。接着，根据记账凭证逐笔登记总分类账。月末时，进行日记账与总分类账的核对，并编制财务报告。此程序简单明了，总账能清晰反映经济业务，但工作量较大，适合规模较小、业务量较少的单位。
汇总记账凭证账务处理程序通过汇总转账凭证，减轻了总账登记的工作量，便于理解账户间的对应关系。但需注意，当转账凭证多时，汇总工作量增大，适合规模较大、业务繁多的单位。
科目汇总表账务处理程序则根据原始凭证和日记账编制科目汇总表，再登记总分类账。这个程序简化了总账工作，易于试算平衡，但不显示账户对应关系，不便于查对账目，适合经济业务较多的单位使用。
会计核算组织程序又叫会计核算形式或财务处理程序。是指会计凭证组会计核算中，会计凭证组织、会计账簿组织、记账程序和方法相互结合的方式。会计账簿组织，是指各自的种类、格式及内部关系；记账程序是指从填制、整理、传递会计凭证，到登记账簿、编制会计报表整个过程的工作步骤和方法。