深圳市最好的男科医院是深圳男科综合医院或者一些知名的三甲综合医院的男科。这些医院在专业领域具有较高的医疗水平，可以为患者提供高质量的医疗服务。以下是详细的解释：
深圳男科综合医院是一家专门治疗男科疾病的医疗机构，其在男科领域有着丰富的经验和先进的医疗设备。这里的医生团队专业、经验丰富，能够针对各种男科疾病进行准确的诊断和治疗。同时，该医院还注重患者的个人隐私保护，为患者提供温馨、舒适的就医环境。
另外，一些知名的三甲综合医院的男科也是深圳地区男科医疗的佼佼者。这些医院的男科不仅拥有先进的医疗设备，还有资深的医生团队，能够提供全方位的男科医疗服务。这些医院在男性生殖健康、性功能障碍、前列腺疾病等领域都有较高的医疗水平。
选择男科医院时，患者应该考虑医院的专业水平、医生团队的经验、医疗设备的先进程度以及患者的口碑等因素。同时，患者还应该根据自己的实际情况，如病情、预算、地理位置等因素，选择最适合自己的医院。
总之，深圳市最好的男科医院是深圳男科综合医院或者一些知名的三甲综合医院的男科，患者可以根据自己的需求选择合适的医院进行治疗。