北大人民医院申占龙团队:抓住乙酰化热点,利用多组学分析联合三种公共数据库和多角度实验验证,拿下12+!

如题所述

蛋白质乙酰化,生命的精细调控者,北大人民医院申占龙团队深入挖掘这一热点领域。他们利用多组学分析,结合TCGA、ENA和GEO等三种公共数据库的强大数据资源,对组蛋白乙酰化进行了详尽研究。首先,他们收集并分析了多个数据集,揭示了蛋白质乙酰化在不同生物学情境下的复杂性。接着,通过转录组测序和单细胞测序,他们确保了生物信息学分析的准确性和可靠性,实验验证了理论推断的实证基础。

在胃癌这一具体场景中,团队发现组蛋白去乙酰化酶(HDACs)与胃癌的肿瘤微环境(TME)密切相关。他们通过建立HDAC评分(HDS)来量化这一影响,发现高HDS与更好的免疫浸润和预后相关。他们不仅关注表达模式,还进行了体内外的多角度实验,包括动物模型和细胞实验,从而验证了HDS在指导免疫治疗策略中的关键作用。

研究者发现,胃癌中HDACs的不同表达亚型与基因组特征、预后显著相关,且与TME细胞浸润有调控作用。通过对ACRG数据集的深入挖掘,他们构建了HDS模型,并发现它作为预后指标的重要性。高HDS状态可能对应着“热”肿瘤状态,具有更活跃的免疫反应。单细胞转录组数据进一步展示了高HDS和低HDS患者TME的差异,这为靶向治疗提供了新线索。

实验验证部分,通过MIF抑制剂实验,团队确认了逆转胃癌微环境的方法,并指出GPX4可能是低HDS肿瘤中值得靶向的分子。通过一系列严谨的实验和数据库分析,申占龙团队揭示了乙酰化在胃癌中的关键作用,为临床治疗提供了新的可能。这一系列创新性的研究工作,无疑为肿瘤学研究领域增添了深度和广度,赢得了国际学术界的认可。
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