为强化混合所有制企业的审计监督，首先，需要完善相关法律法规。具体包括明确混合所有制企业在市场经济运行中的审计规则，建立符合现代企业制度的资本监管指标体系，确保企业财务报告的准确无误，这些都需要在法律制度上予以完善。
其次，政府审计与社会审计应形成联动。避免单一依赖国家审计，而忽视社会审计的作用。民间审计应对所有混合所有制企业的年度财务报表进行常规审计，评估企业财务状况；国家审计则主要聚焦于国有控股混合所有制企业，如涉及注册资本变更、投资活动等关键环节进行审计。
建立内部审计制度至关重要，混合所有制企业，特别是股份制和上市公司，需严格执行内部审计，强化企业自我约束，推动经济效益提升。内部审计应超越传统，转向以企业经济效益为中心，提供评价、鉴定和服务，促进企业经营管理的改进。
此外，对注册会计师审计和内部审计的质量要加强督导，政府审计机关应定期抽查，提供业务指导，以确保审计体系效能的最大化，保障公司制改革和运营的顺利进行。
最后，提高审计人员的素质是关键。审计人员应具备适应混合所有制经济多元化和复杂内部项目的审计技能，通过优化审计机构结构，提升审计工作的专业性和效率，实现对混合所有制经济的精准监督。
混合所有制经济是指财产权分属于不同性质所有者的经济形式。 从宏观层次来讲，混合所有制经济是指一个国家或地区所有制结构的非单一性，即在所有制结构中，既有国有、集体等公有制经济，也有个体、私营、外资等非公有制经济，还包括拥有国有和集体成分的合资、合作经济； 而作为微观层次的混合所有制经济，是指不同所有制性质的投资主体共同出资组建的企业。