棉花苗期虫害较为严重，不同的危害时间和危害方式，给棉苗生长带来较大影响，也对田间防治带来一定难度。害虫的发生有的传播病毒、有的影响棉长推迟发育，还有的失去生长点变成公棉花、或是断茎造成无头棵。例如，小蓟马在棉田发生较早，该虫活动敏捷，怕光，不易被人发现，主要危害棉苗生长点，它危害棉苗生长点后，棉苗只留下两片肥大的子叶不能再生长。棉蚜虫在棉田发生也较早，它繁殖快、食量大、危害重，经蚜虫危害的棉苗，轻则叶片皱缩影响棉苗生长推迟发育，重则叶片脱落死苗。盲蝽蟓也是以危害棉花生长点等幼嫩部分为主的害虫，危害后的棉花有的变成多头棉无序生长，有的叶片呈网状影响光合作用。地老虎更是一种破坏性大的地下害虫，习惯昼伏夜出，白天不易被人发现，尤其是二龄以后的大龄幼虫，夜间活动猖獗，专门咬断茎秆，一夜可破坏2~4棵棉苗，地老虎破坏后的棉田往往补救难度大。无论哪类害虫都要高度重视防治，防治棉蚜虫、小蓟马、盲蝽蟓、红蜘蛛可用50%抗蚜威可湿性粉剂1000倍液或10%吡虫啉2000倍液进行喷雾防治。防治地老虎低龄幼虫时，可用20%速灭杀丁1500~2000倍液或50%辛硫磷1500倍液喷雾。如果防治地老虎大龄幼虫，可用毒饵杀虫法：炒香的麦麸或棉仁饼5公斤，用50%辛硫磷50毫升加入1公斤水，喷拌均匀，傍晚撒入行间。
棉花，是锦葵科（Malvaceae）棉属（Gossypium）植物的种籽纤维，原产于亚热带。植株灌木状，在热带地区栽培可长到6米高，一般为1到2米。
花朵乳白色，开花后不久转成深红色然后凋谢，留下绿色小型的蒴果，称为棉铃。棉铃内有棉籽，棉籽上的茸毛从棉籽表皮长出，塞满棉铃内部，棉铃成熟时裂开，露出柔软的纤维。纤维白色或白中带黄，长约2至4厘米（0.75~1.5寸），含纤维素约87～90%，水5~8%，其他物质4~6%。棉花产量最高的国家有中国、美国、印度等。
棉花在现蕾之前所发生的病害统称为苗期病害，这个时期营养面积较小，根系尚不发达，在遇到低温阴雨天气时，病菌极易感染，轻者棉苗生长弱小，重者造成大面积死苗。从历年发病情况看，立枯病、炭疽病、红腐等最为突出，这些病种发病早、传播快、危害重，必须高度预防。在防苗病方面要突出一个“早”字和一个“防”字。所谓早，就是在未发病之前实行喷药。“防”字当头，就是体现出防病不见病，要有防的意识才能在“早”字上体现出主动性。如果等到见病后治病，会加大防治成本、费工多、弱苗多、易早衰、影响最终产量。三片真叶之前喷药不少于两次，第一次是在齐苗时，喷洒80%乙蒜素，兑成2000倍溶液喷雾，第二次是在1~2片真叶期间，用70%恶霉灵3500倍液喷雾。气温变化较大时，应喷洒营养壮苗的药剂，如天丰素、硕丰481、丰收素、天达2116壮苗灵、福施壮等。
进行棉田土壤除草时，可以选择氟乐灵、拉索、乙草胺、丁草胺、敌草隆、地乐胺等除草剂；进行茎叶除草时，可以选择稳杀得、精稳杀得、盖草能、禾草克、克芜踪、草甘膦等除草剂。在棉花播种前，可以使用48％氟乐灵乳油每亩100-150毫升兑水50公斤后均匀喷雾，施药后马上混土。
在棉花播种后出苗前，可以选用43％拉索乳油每亩200-300毫升兑水50公斤后均匀喷雾；当棉苗长到4叶以后，可以用15％稳杀得乳油50毫升或12.5％盖草能乳油50毫升兑水50公斤进行茎叶处理。
