执业药师实行注册制度。
执业药师注册有效期为五年。需要延续的，应当在有效期届满三十日前，向所在地注册管理机构提出延续注册申请。超过期限，不办理再次注册手续的人员，其《执业药师注册证》自动失效，并不能再以执业药师身份执业。
持有《执业药师资格证书》的人员，经向注册机构申请注册并取得《执业药师注册证》后，方可以执业药师身份执业。持有《执业药师资格证书》的人员未经注册，不具有执业药师身份，不得从事执业药师业务活动，其所出具的与执业药师业务有关的证明，均属无效。
执业药师注册机构须在收到申请之日起30个工作日内，对符合条件者予以注册；对不符合条件者不予注册，同时书面通知申请人并说明理由。
申请执业药师注册的人员，必须同时具备下列条件：
（一）取得《执业药师资格证书》；
（二）遵纪守法，遵守职业道德；
（三）身体健康，能坚持在执业药师岗位工作；
（四）经所在单位考核同意。
有下列情况之一者，不予注册：
（一）不具有完全民事行为能力的；
（二）因受刑事处罚，自刑罚执行完毕之日到申请注册之日不满二年的；
（三）受过取消执业药师执业资格处分不满二年的；
（四）国家规定不宜从事执业药师业务的其它情形的。
首次申请注册的人员，须填写“执业药师首次注册申请表”，并提交以下材料：
（一）《执业药师资格证书》；
（二）身份证明复印件；
（三）近期一寸免冠正面半身照片5张；
（四）县级（含）以上医院出具的本人6个月内的健康体检表；
（五）执业单位证明；
（六）执业单位合法开业的证明复印件。
执业药师注册后如有下列情况之一的，予以注销注册：
（一）死亡或被宣告失踪的；
（二）受刑事处罚的；
（三）被吊销《执业药师资格证书》的；
（四）受开除行政处分的；
（五）因健康或其它原因不能从事执业药师业务的。注销注册手续由执业药师所在单位在30个工作日内向注册机构申请办理，并填写“执业药师注销注册登记表”。执业药师注册机构经核实后办理注销注册，收回《执业药师注册证》。
凡以骗取、转让、借用、伪造《执业药师资格证书》、《执业药师注册证》和《执业药师继续教育登记证书》等不正当手段进行注册的人员，一经发现，由执业药师注册机构收缴注册证并注销注册。构成犯罪的，依法追究其刑事责任。
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