《古墓丽影：暗影》的剧情解析如下：
1. 劳拉的考古工作涉及到了深远的历史渊源，从宇宙大爆炸开始，游戏的背景故事就交织着古老文明的秘密。
2. 游戏中出现了三种“古代语言”——玛雅文、克丘亚文和尤卡坦文。玛雅文明是世界上最古老的文明之一，起源于公元前2600年，并在公元9世纪突然衰落。玛雅人后来北上建立了国家，但到了16世纪被西班牙人征服。尽管现代玛雅人与古玛雅人有血缘关系，但他们的文化已经断代。
3. 阿兹特克帝国在14至16世纪期间建立，16世纪被西班牙灭亡。印加帝国在11世纪成立，15世纪末被西班牙殖民。这三种文明在游戏中的帕依提提城市中有所融合。
4. 帕依提提是一座隐秘的城市，玛雅人在公元前1000年左右开始了一次朝圣之旅，最终到达了亚马逊河的发源地，并在那里建立了定居点。
5. 由于玛雅人的耕作方式导致了水土流失，他们向附近的印加人求助并学习了一种更适宜的耕作方法。随后，他们修建了两座神庙来保护伊希切尔的银盒子。
6. 帕依提提逐渐发展成为一个多元文化的城市，由不同民族的外乡人定居。这里成为了帕依提提，由玛雅祭司和后来的印加混血帝王共同统治。
7. 12至15世纪，帕依提提进入黄金时代，但内部出现分歧。一部分人希望扩张，而另一部分人希望保持隐居。最终，希望隐居的人离开了，将入口修建成了难以通过的道路。
8. 16世纪，印加帝国被西班牙征服。一个印加农民曼科，为了逃避西班牙人的统治，寻找传说中的帕依提提。他成功找到了入口，并带领人们逃到了帕依提提。
9. 曼科被尊为救星，印加军队未能找到他们，只好将入口封堵，改造成了一座印加神庙。
通过以上解析，我们可以看到《古墓丽影：暗影》的剧情跨越了千年历史，涉及了多种古代文明，为玩家提供了一个丰富而深入的故事背景。
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