法律分析：需要。下列凭证为应纳税凭证，其中就包括货物运输合同，所以货物运输合同需要缴纳印花税：(一)购销、加工承揽、建设工程承包、财产租赁、货物运输、仓储保管、借款、财产保险、技术合同或者具有合同性质的凭证。
法律依据：《中华人民共和国印花税暂行条例》第二条
下列凭证为应纳税凭证，其中就包括货物运输合同，所以货物运输合同需要缴纳印花税：(一)购销、加工承揽、建设工程承包、财产租赁、货物运输、仓储保管、借款、财产保险、技术合同或者具有合同性质的凭证;(二)产权转移书据;(三)营业账簿;(四)权利、许可证照;(五)经财政部确定征税的其他凭证。