电子发票系统不支持作废操作，发生退货、电子发票开具有误等情况，开票人应通过开具红字发票进行冲减，电子发票开具红字发票，需要与对应的物流、资金流信息一致。
因为增值税电子普通发票具有可复制性，无法回收的特点，所以增值税电子普通发票一旦开具暂不能作废。开具后如发生开票有误、销货退回或销售折让等情形时，应开具红字增值税电子普通发票，无需退回增值税电子普通发票。
按照国家税务总局关于修订《增值税专用发票使用规定》的通知(国税发〔2006〕156号)第十四条 一般纳税人取得专用发票后，发生销货退回、开票有误等情形但不符合作废条件的，或者因销货部分退回及发生销售折让的，购买方应向主管税务机关填报"开具红字增值税专用发票申请单"。
开票方凭购买方应向主管税务机关出具的《开具红字增值税专用发票通知单》，先开具红字增值税专用发票，然后再开正确的发票。
扩展资料：
根据《中华人民共和国发票管理办法》第二十三条规定，开具发票应当按照规定的时限、顺序，逐栏、全部联次一次性如实开具。
如未按上述规定，属于未按规定开具发票行为，可根据发票管理办法进行处罚。国家税务总局对《中华人民共和国发票管理办法》中的“红字发票管理”规定如下：
一、一笔买卖，全部退货，又能取回原发票注明“作废”，可以重新按实际销售额重新开具发票的，不可开具红字发票；
二、只有在销货退回无法取回原发票注明“作废”的，在取得对方的有效证明，开票方确已将货物验收入库，方可开具红字发票。
“对方的有效证明”指发生销货退回时，除填制退货发票外，退款时，必须取得对方的收款收据或汇款银行的凭证，不得以退货发票代替收据。
若对方（消费者）为个人，在确实不能退回原发票作废情况下，应由消费者个人书面写明情况，注明身份证号码、地址和联系电话，经销货单位负责人批示后方可开具红字发票。再重新开具发票。