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宏基因组测序对样品的生物学重复有什么要求?如何避免重复性较差的问题出现?
如题所述
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推荐答案 2021-10-09
土壤、水体等生态环境样本建议5个或5个以上的生物学重复;取样时每个样品均需多点取样后混匀,降低单个样本
特异性
。
人和动物样本因个体特异性较大,建议10个以上生物学重复;肠道、瘤胃或粪便样本因含有较多
厌氧菌
,要快速取样、迅速低温保存,针对较难富集微生物的样品,如各种物体表面,可采用
缓冲液
洗脱或棉签擦拭等方法。
样品取好后避免长时间放置,需尽快进行DNA提取,送样测序。
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转载---[转录组] 转录组专题——关于
样本重复性问题
小技巧
答:
答:需要。生物学实验中,生物体往往存在异质性,常常需要设置重复,以此确保不是个体的偶然变异对结果产生的影响[1]。若不设置组内
生物学重复
,在投稿时也会受到审稿人的质疑。我们无法判断组内差异所占的比例有多大,可能获得的差异表达基因仅仅是少数个体差异的表现,并不能反映是真正处理效应导致的差异。设置生物学重复...
宏基因组测序
流程
答:
与传统方法相比,基于高通量测序的宏基因组研究无需构建克隆文库,这避免了文库构建过程中利用宿主菌
对样品
进行克隆而引起的系统偏差,简化了实验操作,提高了测序效率。此外,
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研究摆脱了微生物分离纯培养的限制,扩展了微生物资源的利用空间,为环境微生物群落的研究提供了有效工具。通过宏基因组...
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