黄连可以入药，常用来治疗上火症状。人们如果进食了太多辛辣食物，导致口腔溃疡，咽喉肿痛等，可以服用黄连来治疗。因为黄连的寒性比较强，煮汤之后服用能够降低体内的热火，有效改善上火症状。对于牙龈肿痛，咽痛，口舌生疮，口臭等均有很好的治疗效果。如果上火导致了便秘，同样可以服用黄连清热降火，改善便秘症状。
黄连除了可以治疗疾病之外，它还具有消炎，抗菌等功效。因为黄连含有小柴碱，服用黄连之后能够抑制某些细菌，避免细菌对人体健康造成伤害。因此平时服用一些黄连能够预防疾病，例如革兰氏阴性细菌引起的身体疾病，可以多服用黄连来预防。
黄连能够帮助消除炎症，如果肠道出现了水肿，还伴随着腹泻症状，可以服用黄连来治疗。因为黄连里面含有特殊物质小柴碱，摄入之后能够双向调节平滑肌，同时保护人体肠胃黏膜，对于肠胃出现的溃疡有治疗的功效，帮助修复溃疡伤口，恢复身体健康。
黄连具有保肝利胆的作用，服用黄连可以有效缓解肝胆疾病，例如常见的慢性肝炎，胆囊炎等，均可以服用黄连来治疗。部分人因为熬夜，饮食不当，作息不规律等，出现了肝火旺盛症状，肝火旺盛往往会导致患者目赤肿痛，可以服用黄连汤治疗。
黄连里面的有效物质还能够增强人体白细胞的吞噬能力，因为白细胞可以起到防御的作用，帮助杀灭细菌以及病毒，如果白细胞吞噬能力增强，意味着人体免疫力也会提高，就不容易患上疾病了。另外服用黄连还可以抑制细胞的分裂，对于癌细胞扩散有抑制作用。
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