法律分析：被扣的保证金可以开票。如下：1、发票保证金必须严格按照《中华人民共和国发票管理办法》有关规定收取，各地税务机关不得超范围、超标准收取发票保证金；税务机关收取纳税人发票保证金时，应当开具《税务代保管资金专用收据》；2、在本省、自治区、直辖市范围内跨市、县从事临时经营活动不得收取发票保证金；3、发票保证金应当存入税务代保管资金账户，并按照《税务代保管资金账户管理办法》的规定，严格资金的收纳和支付，除缴入国库、退还纳税人外，不得用于其他用途；4、各级税务机关要对以前年度收取的发票保证金进行一次清理检查。纳税人按期缴销发票的，要及时退还发票保证金；纳税人未按期缴销发票的，以发票保证金承担法律责任，按“税务部门其他罚没收入”科目缴入国库。在清理过程中，对已按期缴销发票且纳税人无法找到的，要进行3个月公告。确实查找不到的 ，应将发票保证金存入税务代保管资金账户，并分纳税人进行会计账务处理，待纳税人申请退还时，从该账户办理退款；5、各级税务纪检、监察部门要加大执纪力度，对清理过程中发现的违纪问题要严肃处理。特别是对发票保证金挪作他用的，要按照有关规定追究有关人员的责任；6、各省、自治区、直辖市国家税务局、地方税务局要根据本地实际，建立健全发票保证金的具体管理制度。
法律依据：《中华人民共和国发票管理办法》第二十二条 开具发票应当按照规定的时限、顺序、栏目，全部联次一次性如实开具，并加盖发票专用章。任何单位和个人不得有下列虚开发票行为：（一）为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票；（二）让他人为自己开具与实际经营业务情况不符的发票；（三）介绍他人开具与实际经营业务情况不符的发票。