2006年，琼中女足在海南琼中黎族苗族自治县正式组建，这是海南省第一支业余女子足球队。
2007年，参加在广东英德的一场比赛，但以失败告终。
2008年，参加中学生联赛南区冬训，两场比赛均以大比分败北。
2009年，在全国U16女子足球联赛中获得第六名，在全国U16足球锦标赛中获得第三名。
2010年，成为海南省历史上首支冲进全国U18锦标赛的球队，在该项赛事中获得第四名。
2011年，在全国中学生运动会女足比赛中获得第七名，两名球员入选国家女子足球队中青集训队。
2012年，在全国大学生女子足球锦标赛中获得第三名，首批队员通过努力进入大学校园，还有几人进入了国家女子足球队国青集训队。
2014年，受邀赴西甲学习交流。琼中女足西班牙之行，受邀赴西班牙观看西班牙足球甲级联赛，并前往西甲俱乐部展开学习交流。
2015年，在“2015斯凯孚(SKF)与世界有约”希望工程青少年足球邀请赛中获得冠军，代表中国出战并在2015“哥德堡杯”世界青少年足球锦标赛中获得U12女子组冠军。
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