在特异性免疫和非特异性免疫中补体的激活都起重要作用，它包括①溶解和杀伤作用：细菌进入机体后，细菌的细胞壁脂多糖可通过替代激活途径激活C3（属非特异性免疫），细菌与特异性抗体结合后可通过经典激活途径激活补体（属特异性免疫）。其结果均导致细菌细胞壁的破坏。另外，输血时因输错血型，也可因血型抗原与对应抗体结合，通过经典激活途径激活补体，而导致溶血反应。有膜的病毒也可通过这个机制遭到破坏；③免疫粘附作用：与C3b结合的颗粒或抗原-抗体复合物，有粘附
灵长类红细胞或非灵长类
血小板的能力。粘附后形成体积较大的凝聚物，易被具有C3受体的吞噬细胞吞噬消除。中和病毒作用也主要是通过这个机制发挥的；③趋化作用：补体在激活过程中释放的C3a、C5a、C567等对
中性粒细胞和巨噬细胞有趋化作用，可吸引它们向病原体存在的部位移行和集中，进行吞噬作用，同时也造成炎症反应；④过敏毒素作用：C3a、C5a能刺激肥大细胞和血小板释放
组织胺等药理活性物质，从而引起平滑肌收缩、血管通透性增高等
超敏反应；⑤促进血凝作用：C6有促进血凝的作用，在正常人凝血过程中，C6可被消耗。