一、审计对象多元性
混合所有制经济最大的特点“混合”，混合所有制经济的投资主体是多元化的，由多不同所有制经济的投资主体联合投资，通过外向引进、横联合、纵向招股等途径，从而实现各种经济形式的联合。以多种经济成分作基础，通过多种联合途径，可以产生多种多样的混合经济具体形式。从目前来看，混合所有制企业要有股份制企业、股份合作制企业、中外合资经营企业、中外合作经营企业等。因此，混合所有制企业审计的对象具多元性。
二、审计内容复杂性
由于混合所有制经济中存在同投资主体，对企业财务信息需求多样化，要求企业审计规划和内容的全面化。不仅要对国有资产加强审计监督，进而保值增值并加强企业内部控制，提高企业管理水平;且要对企业财务状况、经营成果进行鉴定，满足不同投资体对企业财务信息的要求，体现投资者的共同意志。同时，于混合所有制经济具有“既公既私”的双重性质，必须按市场经济的要求和有关审计法律法规，对其审计内容加以规范。
三、审计结果公开性
对混合所有制企业审计结果的处理不同于一般企业的审计，有其一定的特殊性，即一定限度的公开性。这是因为，混合所有制企业中的各类投资人为了保护自己权益，了解和监督企业管理层履行经济责任的情况，都有对企业进行审计和监督的权力要求，只有信息一定限度地公开，才能满足各类投资人的权利要求。
四、审计风险较高
混合所有制经济中各投资主体为维护自己的合法权益，都要对审计监督提出要求。审计无论从内容到程序、结论等方面都将遇到强烈挑战，审计风险和法律责任增大。同时，由于混合所有制经济的单位(企业)组织形式多样化，各种形式的政策地位和实际运作方式不一样，审计面临许多新情况、新问题，这就对审计人员的素质、作风等提出了新的要求，也增大了审计工作的难度。
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