最近在做一项有关大鼠野生种与改良种的人工选择方向相关分析，涉及到混池测序的Fst计算。查阅文献找到一些可以对混池测序数据分析的已发表软件，如 popoolation2 qtlseqr mutmap、mutmap+、qtl-seq ; PoPoolation2 是通过比较两个混合群体得位点频率的经典pipeline，而这里笔者推荐一个2018年发表的R package-- Poolfstat 。
最近一篇NC中" A large and diverse autosomal haplotype is associated with sex-linked colour polymorphism in the guppy "提到了Poolfstat，其发表于2021年11月( 引用文章 ),实现了对Pool-seq数据的FST估计，CRAN位置: Poolfstat . 继续查阅发现早在2018已首次被作者发表( 文章链接 )，2020年Poolfstat开始被广泛使用。如：
VCF文件 中149,155,260,270,691分别对应一个群体（图片来源网络），为群体的ID。
假设每个群体的ID为群体内样本数。
注意：结果中的POS可能存在科学技术