事业单位应设置“事业基金”科目，核算事业基金的各项来源、运用和结存，并在该科目下设“一般基金”和“投资基金”两个明细科目。
事业基金的主要账务处理如下：
（一）年末，将“非财政补助结余分配”科目余额转入事业基金，借记或贷记“非财政补助结余分配”科目，贷记或借记本科目。
（二）年末，将留归本单位使用的非财政补助专项（项目已完成）剩余资金转入事业基金，借记“非财政补助结转—××项目”科目，贷记本科目。
（三）以货币资金取得长期股权投资、长期债券投资，按照实际支付的全部价款（包括购买价款以及税金、手续费等相关税费）作为投资成本，借记“长期投资”科目，贷记“银行存款”等科目；同时，按照投资成本金额，借记本科目，贷记“非流动资产基金—长期投资”科目。
（四）对外转让或到期收回长期债券投资本息，按照实际收到的金额，借记“银行存款”等科目，按照收回长期投资的成本，贷记“长期投资”科目，按照其差额，贷记或借记“其他收入—投资收益”科目；同时，按照收回长期投资对应的非流动资产基金，借记“非流动资产基金—长期投资”科目，贷记本科目。