第一部分
打入内部 握手言和 (第01集-第16集)
第1集
1949年10月1日，开国大典宣告了旧时代的灭亡和新中国的诞生。11月中下旬，解放军主力由黔西转入川南，解放大西南指日可待。而此时，一场没有硝烟的战争却刚刚开始。
在地下阴暗的角落里，国民党军统潜伏在重庆的特务头子“老板”和他的副官李瑞山接收到已仓皇逃往台湾的国民党高层的指令，纠集了林玉仙、孟海马、张保之、洪雪儿、吴枢斗等特务头目，领导了一支三千多人的秘密队伍，准备进行对共党高级人物实施暗杀以及对于重庆市内未及摧毁的重点目标展开破坏的“猎鹰计划”。
“老板”此时也获悉，由军统局长毛人凤派往重庆监督执行“猎鹰计划”的少将编练官程汤也已经到达彭水。而与此同时，我军四野特种兵纵队特务营营长燕双鹰与指导员高进率领特务营，化装成国民党部队，干净利落的一举击溃了国民党驻彭水十五兵团142师的城防部署。
正当燕双鹰正准备率部乘胜占领敌142师师部的时候，却遇到了意想不到的阻击，面对师部院里的冷枪狙击，燕双鹰只身闯进院中…
第2集
燕双鹰和高进
燕双鹰只身闯进142师师部大楼，他凭借自己敏捷的身手和过人的胆色，终于将埋伏在楼里的一群神秘狙击手逐一击毙。而这群神秘狙击手的头目竟然就是常年在国外受训，并被毛人凤秘密遣往重庆监督执行“猎鹰计划”的少将编练官程汤！燕双鹰还俘获了一个与程汤同行的女人——麻省理工毕业的军械制造专家赵雅琴。
据赵雅琴交代，由于她的家人被军统特务控制，在要挟之下她被迫与程汤一同前往重庆。燕双鹰在程汤的行李中发现了有关“猎鹰计划”的信息。“猎鹰计划”到底蕴含了怎样的阴谋呢，而眼前这个貌似清白的女人似乎又与“猎鹰计划”有着千丝万缕的联系，燕双鹰不禁陷入沉思。
此时，我解放军主力已进驻重庆。第二野战军情报处处长李延平获悉，潜伏在重庆的大批军统特务由一个化名为“老板”的特务头子率领，正在策划一场暗杀行动。李延平立刻展开部署，要求情报处查明暗杀行动的计划，并严格保护打入敌特内部的我军情报员“五号”。
第3集
“老板”得知彭水已经被我军占领的消息后略显惶恐，他试图用电台与程汤取得联系。殊不知程汤藏在留声机里的电台早已被心思缜密的燕双鹰起获。燕双鹰冒程汤之名与“老板”联系，经过一番电文往来，燕双鹰断定“老板”与程汤尚未谋面，于是制造出程汤一行已安全逃离彭水的假象。而此时，李延平也得知了程汤一行被燕双鹰击毙的消息，根据对程汤携带的文件进行分析，种种迹象表明敌特“猎鹰计划”的第一步行动就是要在沙坪坝大礼堂对我军野司首长实施暗杀，李延平即刻启程赶往彭水县。
赵雅琴的身份得到了证实，她的确是受到了程汤的挟持——“猎鹰计划”需要她这样的军械专家。燕双鹰冒程汤之名与“老板”取得联系后，想要进一步获知“猎鹰计划”的真相，于是他从特务营挑选了一批精英，让他们在赵雅琴的指导下熟悉狙击步枪的性能，他自己也换上了程汤的行头 ——皮风衣大墨镜。很显然，一个偷梁换柱打入敌人内部的大胆冒险计划已经在他胸中逐渐酝酿成形…
燕双鹰乔装卧底的计划与李延平的想法不谋而合。经过讨论决定，首先要搭救赵雅琴在贵阳的家人，以便让她能放心的参加此次卧底行动。其次是让燕双鹰到达重庆后尽快与五号情报员取得联系，以确保粉碎“猎鹰计划”并将敌特一网打尽。
第4集
为了让燕双鹰“扮演”得与常年在国外受训的程汤更为逼真，赵雅琴还教他掌握了基本的英语口语。此时贵阳传来消息，原来赵雅琴的家人早已被军统特务杀害，得知此事后丧失理智的赵雅琴将一腔的愤怒与怨气全部发泄在燕双鹰的身上，还险些误杀了燕双鹰。尔后赵雅琴痛定思痛，拒绝了燕双鹰送她回贵阳的好意，更加坚决的加入到此次卧底行动中来。
“老板”接到“程汤”(燕双鹰)的消息，马上进行了严密的部署并派潜林玉仙等特务头目前往太白山接应“程汤”一行，然后一路护送他们赶赴重庆。燕双鹰等人到达预定的接头地点，却发现林玉仙身受重伤，她的手下也已悉数丧命。正当燕双鹰惊诧不已的时候，他们却被我军太白山游击队包围，而此时的燕双鹰和他的手下都是一身的国民党军服与美式装备…
燕双鹰断定眼前的意外状况不过是“老板”对他的试探，他不费吹灰之力就制服了这些“游击队员”并揭穿了他们的真实身份。
第5集
林玉仙对“程汤”的身份笃信不疑并将一行人引至她的老窝安顺寨进行休整。诡计多端的“老板”接到林玉仙的电报后却还是将信将疑，决定继续试探。通过短暂的接触，林玉仙已经被燕双鹰的成熟机智吸引，她百般向燕双鹰示好却引得逐渐对燕双鹰心生爱意的赵雅琴醋意盎然。当然，这也使得一直钟情于林玉仙的特务头目孟海马妒火中烧。孟海马借为燕双鹰一行接风之机大摆鸿门宴，纠集了一伙喽啰想让燕双鹰出丑。
关东大侠出身的燕双鹰不费吹灰之力连过“毒锅取钱”“过钉板”和“火刀山”三关，孟海马目瞪口呆。接风宴不欢而散，林玉仙重新准备了酒菜款待燕双鹰一行，试图接近燕双鹰，却被燕双鹰当面揭穿——她不过是喜欢男人为她相互争斗。在鸿门宴上丢尽颜面的孟海马却贼心不死，公仇私愤齐来，他开始怀疑燕双鹰的真实身份，并发誓要置燕双鹰于死地。
第6集
赵雅琴似乎与燕双鹰走得更近了，燕双鹰甚至还向她吐露了他曾经爱过一个女人，但是那个女人却死掉了。林玉仙为了报复燕双鹰的直面中伤，只能假意投入孟海马的怀抱。头脑简单的孟海马却不知道林玉仙只是在利用他。
重庆方面，李延平接到地下工委负责人吴玉霞和情报参谋刘庚的消息，“五号”传信，猎鹰计划的第一步就是刺杀野司首长。与此同时，高进在重庆建立了交通站，以配合燕双鹰行动，并顺利与李延平取得了联系。
燕双鹰一行踏上了宜宾开往重庆的客轮，特务头目洪雪儿和吴枢斗早已布下迷魂阵，准备一路试探。燕双鹰获知赵雅琴的军械专精是爆破，赵雅琴也不失时机的与他接近。而此时“五号”情报员也意外的出现在船上，并频繁的试图与燕双鹰接触。燕双鹰觉得事有蹊跷，正欲查明这个“五号”的真实身份，不料偷偷跟上船的林玉仙却趁乱溜进了赵雅琴的舱房。
经过一番周旋，燕双鹰意识到, 这个“五号”不过是敌特的又一次试探，旨在查实自己的真实身份。燕双鹰一举击毙了假“五号”和胁迫他与其当面对质的特务，洪雪儿和吴枢斗精心安排的试探计划宣告破产。
第7集
一波未平一波又起，同志们突然发现赵雅琴失踪了。林玉仙挟持了赵雅琴，企图对燕双鹰进行报复，燕双鹰顺水推舟，不仅打探得一些“猎鹰计划”的细节，还不费吹灰之力就救出了赵雅琴，并且当着孟海马的面揭穿了林玉仙的阴谋。
获救后的赵雅琴向燕双鹰表明了爱慕之情，却并没有得到燕双鹰的正面回应。燕双鹰处处以执行卧底计划为先，却将个人感情问题抛之脑后，这使得与他朝夕相处并且爱意渐浓的赵雅琴痛苦不堪。林玉仙想与燕双鹰握手言和，并告诉他假“五号”的试探出自洪雪儿和吴枢斗之手，实际上也是老板暗中指使的，燕双鹰故作气愤却暗地里提醒自己要紧绷神经不漏破绽，以便将老板一伙彻底铲除。
林玉仙坦言她绝不会轻易放弃燕双鹰。赵雅琴也希望通过这次任务拉近她与燕双鹰的距离。身处赵雅琴林玉仙两个女人的夹缝之中，燕双鹰一心破敌，并无他念。重庆，李延平和吴玉霞已经做好了各项准备，等待燕双鹰一行到来。洪雪儿奉老板之命前往码头迎接燕双鹰，并将他们一行安排在沙坪坝中街十六号公寓。第8集
老奸巨猾的老板并没有露面，而是派副官李瑞山假扮自己前往十六号公寓。假扮老板的李瑞山与燕双鹰等人商谈沙坪坝大礼堂的刺杀计划。计划决定由燕双鹰全权负责这次行动，燕双鹰调兵遣将开始部署。而李延平也准备安排“五号”与燕双鹰接头。燕双鹰与林玉仙扮作游人到大礼堂附近拍照以便观察附近地形。林玉仙问及燕双鹰对老板的印象，燕双鹰告诉她早已识破他见到的老板是他人假扮，只是没有当面揭穿。林玉仙对燕双鹰敏锐的洞察力佩服有加。
燕双鹰潜入沙坪坝大礼堂与李延平接头，二人互通情报后决议，用移花接木之计让燕双鹰完成大礼堂刺杀野司首长的猎鹰一号行动，以便使燕双鹰获得老板的绝对信任。同时，李延平也将“五号”情报员的情况告诉燕双鹰，并准备安排二人在百乐门舞厅接头，以便相互配合铲除敌特。
林玉仙暗中与老板见面，向他汇报李瑞山扮演的老板被燕双鹰识破的情况，老板虽然大为震惊，但也消除了一些对燕双鹰的怀疑，于是老板决定等沙坪坝大礼堂刺杀行动完成后再亲自与燕双鹰见面。燕双鹰按照原定计划到百乐门舞厅与“五号”接头，“五号”却没并有现身，他只是躲在暗处将李延平规定的接头信物——一支老刀牌香烟安全的交到了燕双鹰的手上。
第9集
林玉仙与赵雅琴为争得燕双鹰而产生一些摩擦，燕双鹰极力回避此事，并劝告二人将心思多用在工作上。赵雅琴心中不快却也只能听从。林玉仙却不依不饶，处处与赵雅琴为敌。并在研究具体刺杀方案时，林玉仙赌气提出冒险方案，燕双鹰当众怒斥林玉仙自私不负责任，林玉仙假意以死相逼却也被他揭穿。林玉仙气急败坏拂袖而去。
燕双鹰与众人指定的刺杀计划大胆周全，老板十分满意，并责令林玉仙服从燕双鹰指挥。而此时燕双鹰却在苦苦思索“五号”暗中传递给他的那一支老刀牌香烟究竟有何玄机…
老板批准了燕双鹰制定的刺杀计划，任命林玉仙为狙击手之一，并责令林玉仙向燕双鹰道歉。赵雅琴再次勇敢的向燕双鹰表达爱意，燕双鹰再也无法控制内心的情感，紧紧拥抱了赵雅琴。但是长期刻意回避情感的习惯让燕双鹰马上又回到了现实世界，这次感情的碰撞犹如昙花一现转瞬即逝，内心的纠结也让燕双鹰陷入莫名的痛苦之中。
在交通站，高进将燕双鹰的刺杀计划递到了前来接头的李延平手中。
第10集
在李延平的帮助下，燕双鹰和赵雅琴潜入礼堂装上了爆破装置，同时，燕双鹰也加紧练兵，以便狙击手在爆炸的掩护下顺利完成狙杀。
特务头目张保之从彭水带回消息，说共军攻占彭水时还歼灭了一个特工小分队，老板得知此消息断定燕双鹰一行是冒充的，他决定暂时中止刺杀行动。燕双鹰和赵雅琴回到公寓发现兄弟们都不在，很快他又接到老板的通知到江边废墟见面。江边废墟中，老板布下天罗地网，燕双鹰的说辞虽然天衣无缝，甚至让张保之也无言以对，但老板认定他不是程汤。燕双鹰身处重围，老板部署在废墟中的一众枪手拉响了枪栓。
在赵雅琴的爆破和狙击的掩护下，燕双鹰杀开一条血路正准备全身而退的时候，却发现自己手下所有的兄弟都早已惨死在水池中。盛怒之下，燕双鹰大开杀戒。
第11集
经过一番奋战，燕双鹰将孟海马在内的未来得及撤离的枪手悉数击毙。血雨腥风过去之后，面对着同志们的遗体，燕双鹰悲痛欲绝，发誓一定不让他们的血白流。
燕双鹰与赵雅琴连夜赶回十六号公寓，却发现林玉仙守候在这里，原来林玉仙坚信燕双鹰就是程汤，且始终对他心存爱意，但燕双鹰从老板布下的陷阱中顺利脱身却让林玉仙大为诧异。燕双鹰怒斥老板错杀忠良，并誓要与之为敌。紧接着燕双鹰又宣布了一个更令人震惊的计划——他要继续完成刺杀行动。赵雅琴自然是希望帮助燕双鹰，林玉仙也誓死追随，三个人的手紧紧握在了一起。
第二天，沙坪坝人群涌动，野司首长在警卫护送下进入大礼堂。燕双鹰与林玉仙潜入礼堂到达预定的狙击点，只等炸弹爆炸就实施狙杀。卫生间内，赵雅琴深吸一口气，将手中的引爆掣狠狠的按了下去，但是安装在礼堂门口的炸弹却并没有爆炸。得不到爆炸的掩护，燕双鹰和林玉仙准备冒险实施狙杀。关键时刻，赵雅琴排除了引爆摰的故障，引爆了炸弹，燕双鹰和林玉仙成功狙杀“野司首长”，并从大礼堂内安全撤离。当然，这两名中弹的“野司首长”其实是李延平安排的穿戴了防弹钢板的情报员。李延平希望能借此事从舆论上斥责敌特的卑鄙行径，而燕双鹰却希望通过这次行动打消老板的疑虑，以便自己顺利的打入敌人内部。
第12集
燕双鹰拟定了新的行动计划并送到高进手中，高进得知燕双鹰手下的战士都已惨死的消息后也悲痛不已。燕双鹰单枪匹马击毙废墟的枪手并安全脱身的消息使得老板大为震惊，而此时林玉仙又带来了她与燕双鹰成功狙杀野司首长的消息，老板陷入极度的恐惧与不安之中。
诡计多端的老板一面让林玉仙向燕双鹰转达自己和谈的诚意，另一方面却安排洪雪儿、吴枢斗、张保之等人跟踪林玉仙并对燕双鹰进行暗算。五号情报员将老板的行动计划传递到燕双鹰手中，而燕双鹰却早就预料到老板会有这一手。
老板派出一队枪手跟踪林玉仙到达燕双鹰藏身的登云旅社，而燕双鹰却早就识破了老板的诡计，他带领赵雅琴和林玉仙守候在旅社对面的屋顶上，将前来行刺的这些枪手悉数击毙
第13集
最后一个杀手临死前告诉燕双鹰是张保之安排的暗杀，并告诉燕双鹰春意麻将馆是张保之的秘密联络点。老板刺杀燕双鹰不成却惊动了解放军城管部队，为安全起见，老板被迫下令关闭城中所有联络点。
燕双鹰和赵雅琴来到春意麻将馆。虽然联络点都接收到老板的命令关闭了，但是麻将馆老板经不起燕双鹰的拷问，终于交待出张保之的联络人宋副官藏身于永记绸布庄。经过一番巡视和分析，燕双鹰和赵雅琴立即赶往永记绸布庄，准备一探究竟。其实燕双鹰早就料到麻将馆老板就是张保之的联络人宋副官，正当宋副官得意于他骗过燕双鹰顺利脱身的时候，燕双鹰却再次出现在他面前。
得知张保之真正的藏身之处是牛角沱延明巷十号之后，燕双鹰击毙了麻将馆中一众特务，然后炸毁了麻将馆。登云旅社枪战和春意麻将馆爆炸引起了李延平和吴玉霞的注意，他们很快也意识到这是燕双鹰给他们留下的线索，于是他们顺藤摸瓜又打掉了几个敌特的秘密联络点。
第14集
联络点暴露和人员伤亡让老板损失惨重，为保存实力，老板派洪雪儿和吴枢斗安排张保之出城，而燕双鹰却又提前一步来到牛角沱张保之的栖身之所。
张保之使尽各种招数想要逃跑，最终还是被燕双鹰结果了性命。燕双鹰还给晚到一步的洪雪儿和吴枢斗留下一件意外的礼物——炸弹，让洪雪儿和吴枢斗不禁心惊胆寒。
燕双鹰和赵雅琴悄悄返回十六号公寓安顿下来，赵雅琴刻意接近燕双鹰而燕双鹰却视而不见。燕双鹰想要联系林玉仙，赵雅琴明明知道这是为了工作却还是郁闷不已。
第15集
张保之的死讯让老板坐立不安，目前的这种局势更是让老板觉得骑虎难下，想和解，却很难再次得到燕双鹰的信任; 继续斗法，自己一定会蒙受更大的损失。在李瑞山洪雪儿等人的建议下，老板最终决定请毛人凤出面调停此事。燕双鹰的这一系列行动取得了非常好的效果，李延平和吴玉霞决定趁此机会继续向敌人施加压力。
林玉仙将毛人凤的调停书转交到燕双鹰手上，并转告他老板请他到安顺寨见面。燕双鹰从调停书上获知老板的真名叫严森。经李延平查证，这个严森是军统中资历最深的老牌特务之一。终于获得敌人的信任使燕双鹰无比兴奋，他也终于腾出时间悼念去世的战友。看到燕双鹰为战友失声痛哭，赵雅琴也不禁心潮澎湃，对燕双鹰更是怜爱有加。
重庆是个龙蛇混杂的地方，九号码头上，为人正直的清水袍哥老大霍杰扣押了一批日本货物，而货主贾老板却买通袍哥二当家刘天龙杀害了霍杰。当上老大的刘天龙还答应贾老板一定帮他找回那批货物。刘天龙不仅杀害了霍杰，还想赶尽杀绝除掉霍杰七岁的儿子如常。霍杰的心腹景标连忙带着如常仓皇出逃，刘天龙的狗腿子方五桥带了一帮人穷追不舍。
第16集
景标带着如常翻墙逃进一个院子，这院子不是别处，正是燕双鹰和赵雅琴藏身的十六号公寓。景标和如常急于逃命，一言不合就跟燕双鹰交起手来，景标本是袍哥，也教过如常一些拳脚功夫，但他们怎能是燕双鹰的对手。不打不相识，一番交手，燕双鹰看出这叔侄两个不是坏人，景标虽然隐藏了自己的袍哥身份，燕双鹰却依然仗义出手赶走了方五桥一票人，将景标和如常搭救下来。
景标和如常更是为燕双鹰的义气和身手所折服。燕双鹰和赵雅琴正在考虑怎样才能让景标和如常彻底脱离险境，景标却说他准备带如常去宜宾投奔如常的小姑——霍杰的妹妹。燕双鹰便决定和他们一起离开重庆。
燕双鹰、赵雅琴和林玉仙与景标和如常分头登上开往宜宾的客轮，而此时刘天龙的手下也跟踪他们上了船。轮船上，赵雅琴和林玉仙为了与燕双鹰接近而争风吃醋，而机警的燕双鹰却发现船上状况有异。一番打探，燕双鹰查出刘天龙居然也在这条船上，就住在三层的特等舱房。
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