个人认为，复旦大学要更好一些。从学科专业来看。复旦和上交虽然都是综合性大学，但是复旦的文科和理科，相对比较强，而上海交大的工科更强一点。从这个角度，复旦和上交的差距，有点像北大和清华。
从人文学科的角度，复旦的人文社科和数理化生更强，哲学学科、理论经济学学科、政治学学科、中国史学科都是A+，一共有10个A类学科。
复旦大学，简称“复旦”，位于直辖市上海，是中华人民共和国教育部直属的全国重点大学，中央直管高校，教育部与上海市重点共建，位列国家“双一流”、“985工程”、“211工程”建设高校。
入选珠峰计划、强基计划、111计划、2011计划、卓越医生教育培养计划、卓越法律人才教育培养计划、国家建设高水平大学公派研究生项目、新工科研究与实践项目、中国政府奖学金来华留学生接收院校、深化创新创业教育改革示范高校、首批学位授权自主审核单位。
是环太平洋大学联盟、九校联盟、全球大学高研院联盟、中国大学校长联谊会、东亚研究型大学协会、新工科教育国际联盟、医学“双一流”建设联盟、长三角研究型大学联盟、 长三角高校智库联盟、中俄综合性大学联盟成员，是一所综合性研究型大学。
以上内容参考：百度百科——复旦大学
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