南京三乙医院有以下几家：
1. 南京市第一医院
2. 南京市中西医结合医院
3. 南京医科大学第二附属医院
解释：
南京作为一座大城市，拥有众多医疗机构，其中三乙医院是医疗服务的较高水平代表。以下是几家在南京较为知名的三乙医院的详细介绍：
1. 南京市第一医院：
该医院是南京市较早成立的大型综合性医院之一，拥有先进的医疗设备和一支经验丰富的医疗团队。作为三乙医院，它提供了全面的医疗服务，包括内科、外科、妇科、儿科等多个科室。
2. 南京市中西医结合医院：
这家医院结合了中医和西医的优势，擅长于中西医结合治疗各种疾病。医院拥有多个专业科室，为患者提供全方位的医疗服务。作为三乙医院，该医院在医疗质量和服务水平上都有较高的标准。
3. 南京医科大学第二附属医院：
该医院是一家大型综合性医院，与南京医科大学紧密合作，拥有较高的学术水平和医疗技术。作为三乙医院，它提供了多种医疗服务，包括高级手术、重症监护、康复治疗等。