HPV一般可以分为160多种亚型，而亚型又分为两大种类型，可以分为低危型和高危型，低危型和高危型HPV病毒导致的疾病不同，致病性也有所不同。
根据其引起宫颈癌的可能性，癌症研究机构，将其分为高危型、疑似高危型和低危型。
常见高危型有：16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59
疑似高危型：26、53、66、67、68、70、73、82
低危型：6、11、40、42、43、44、54、61、72、81、89
高危、疑似高危型持续感染可能导致宫颈癌，其主要致病型别为16、18型，如检测出16、18型阳性，须直接转诊阴道镜。
低危型持续感染可能导致生殖器疣。
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