这个很难说啊...这问题也容易滋事
问题一：
人口统计的口径很难统一 现在正在进行第六次全国人口普查 到时会有比较准确的结果
在这次第六次全国人口普查中，北京人口普查首次覆盖外籍常住人口。所以啦~更难看出来了...
2009年12月8日，上海市人口和计划生育情况驻沪领馆通报会透露，2008年在沪外国常住人口为15.21万人。
北京市公安局出入境管理处称，截止到2009年10月为止，在北京居住时间超过六个月的外籍常住人口已达到11万。在这11万常住外籍人口中，外籍留学生约有3万人，外籍工作者约为4万人，外国驻京使馆工作人员及其家属约1万人，其余持探亲签证等来京外籍人士约为3万人。
若基于以上统计数据真实的情况下，上海外籍常住人口高于北京外籍常住人口。
再来一个比较鸡肋的比较（可忽略）：
我们根据08年的数据来对比下，推出近似结果：
上海全市面积7,037.50平方公里，2008年全市常住人口1,888.46万，其中户籍人口1,371.04万人，外来人口517.42万人，人口密度2,638人/平方公里。
北京全市面积16,410.54平方公里，2008年全市常住人口1,695万人，其中户籍人口1229.9万人，外来人口465.1万人，人口密度1,033人/平方公里。
个人初步结论：尽管北京外来人口占全市人口的比例高于上海0.1个百分比 但是从总量来说 还是有一定差距的 且以上数据未标明外国人口占外来人口的比例为多少。所以初步估计，上海外国常住人口高于北京外国常住人口。
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问题二：
若从纯环境角度出发的话，上海的天气及空气质量等，应该会优于北京，外国可能会更喜欢住北京。
从教育留学角度来说，据前两年数据表明，上海留学生3万余，位于全国第二，仅次于北京4万余。清华北大在世界大学的排名毕竟不是吹出来的啊~~ 上海的软件还有待提高。
从文化吸引力的角度来看：
这一方面的数据很难查证，亦很难从其他发面佐证，本想从旅游人口角度入手，均失败。但是相信，从传统的中国文化角度出发的话，北京作为全球拥有世界文化遗产最多的城市，皇城的悠久历史文化积淀更能吸引外国友人。
（若想单纯从外国人居住喜好上来判断的话，本人觉得有些困难，以下从个人理解角度入手分析。因为外国人在华工作学习，很大程度上并不是主观选择，而是客观选择的。）
外商在华投资在很大程度上影响着外国人常住人口的变化，因此，我想从外商投资角度来分析一下。
先从外商投资的角度来分析：
查询上海工商官网，上海市工商行政管理局2010年6月基本业务统计数据显示，外商投资企业累计企业户数达54345户，累计投资总额达3208.12亿美元，累计注册资本达1898.87亿美元。
根据北京市工商局7月16日发布统计数字显示，北京市外商投资企业累计登记14335户，投资总额1084.6亿美元，比去年同期增长5.9%。注册资本641.8亿美元，外方注册资本522.7亿美元。
这组数据的差异是比较明显的。外商比较喜欢上海的说...
再从京沪吸引外商的环境角度来分析：
（特别说明：由于问卷设计及调查的局限，这一调查结果只能是感性、简单甚至比较模糊的判断，我将在参考资料中给出网址，以供详细参考）
经营环境：北京在研发方面比上海更有优势，高出1个百分点，实际情况也证明，跨国公司在建立研发机构时，也更愿意选择北京。关于经营环境的其他问题，如市场增长潜力、市场规模等，均超过60%的被调查者认为上海比北京好。
宏观环境：调查表明，65%的被调查者认为上海经济、社会态势更好；只有14%的人认为北京更好。
政府服务：政府服务方面有9个问题。调查结果全部是上海好于北京，所有问题选择北京的被调查者均没超过30%。这表明，北京的政府服务水平较上海确有明显差距。
生活环境方面的调查同样呈现出倾向于上海的结果。除社会公德水平外，其他问题上海得分都比北京高。生活环境、气候、城市卫生，外籍人员生活便利度，中外文化差异等3个问题，公众对上海的评价明显好于北京。
京沪各有优势，在吸引外资方面，在全球21个主要城市中，走在了所有城市的前列。（见参考网址3）上海在“外商直接投资总额”以及“外商投资新建项目数量”方面都独占鳌头；在这两个类别中，北京在全球21个主要城市中的排名分别为第二和第四位。在外商投资创造的就业项目总价值方面，北京和上海甚至超过了传统上占主导地位的世界城市。
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最后需要强调的是，本人真心的觉得，京沪两市从不存在孰优孰劣的问题。
北京市，四个中央直辖市之一，全国第二大城市及政治、交通和文化中心。上海，中国大陆第一大城市，四个中央直辖市之一。是中国大陆的经济、金融、贸易和航运中心，拥有中国最大的工业基地、最大的外贸港口。我们必须看清，以上的区别在于城市的职能定位不同。京沪两市同为中国不可缺少的大城市，都为祖国的繁荣富强做出了贡献。
以上所有问题的分析纯属个人拙见，分析可能不甚全面，数据来自政府官网或网络门户，真实性（在天朝，大家懂的）自行判断。
参考资料：
http://finance.sina.com.cn/g/20040407/0949706953.shtmlhttp://finance.sina.com.cn/g/20040407/0939706928.shtmlhttp://www.p5w.net/news/gncj/201004/t2926862.htm