孤山古城即孤山堡于明朝明宪宗正统二年(1437年)设置
据史料记载，唐初消灭东突厥后，朝廷任命折华为府谷镇扼使镇守石塘关。唐末折华后代折宗本、折嗣伦又因镇压黄巢起义有功，折宗本为振武军沿河显镇都知兵马使，折嗣伦为麟州(神木)刺史。948年，折从阮任后汉永安军(治府谷)节度使，其子折德扆任团练使。在此期间，折氏一直都没有中断对石塘关的维修和扩建。
2.北宋一朝，折氏家族曾率兵在孤山、府州一带与西夏军队进行了数十次战斗。南宋初年，折可求带领三州九寨投降金国，孤山寨归金国所有。此后金国和西夏为争夺麟府属地，在孤山川一带争战不息。
3.由于孤山时归西夏，时属金国，当地传说老百姓门上都会挂一个牌子，一面写着西夏，一面写着金国。这样西夏军来了牌子翻成西夏，金军来了牌子翻成金国，保证两方军队都不会侵扰。
4.为抵御蒙古入侵，从明朝中叶开始便在蒙汉边境广置军堡，孤山堡也是于明宪宗正统二年(1437年)设置。明穆宗隆庆三年(1569年)，孤山驻军在城内原折家古居遗址修建了衙门和仓库，驻兵2600名。