流沙过滤器的工作原理包含两个相互关联却又独立进行的步骤：原水过滤和滤料清洗再生。这两个过程在过滤器内部的不同部分同步进行。原水过滤主要依靠高位差或泵的推动力，水流从下往上流动，通过砂层进行过滤，这个过程中，砂子作为滤料，起到了关键的拦截作用，能够有效截留水中的悬浮物质。
滤料清洗再生的过程则有所不同，它采用压缩空气作为动力。当过滤完成后，压缩空气会从底部注入，推动砂层中的杂质上移，然后通过反洗装置排出，这样滤料得以再生，恢复其过滤效能。这种设计使得整个过滤过程既能实现清洁水的产出，又能保持滤料的高效运作。
通过这种方式，流沙过滤器巧妙地实现了水的净化和滤料的持续使用，确保了出水质量和过滤器的长期稳定运行。
流砂过滤器是水处理及污水净化除去固体悬浮物和其它杂质是最经济有效的解决方案，它可以有效地去除原水（或废水）中悬浮颗粒物及胶体物等杂质。现在，市场上上的流砂过滤器一般都是连续的，即不需要配置清水池和大功率反冲洗水泵，使过滤操作得以续稳定的运行，具有过滤效率高、能耗低、操作简便等优点，可广泛应用于各种水处理工艺。