首要任务是统筹全市审计业务，对市级财政收支和相关财务收支进行审计监督，确保真实、合法和效益，维护财政秩序，提升资金使用效率，促进廉政建设，并支持经济社会健康发展。对审计结果负有监督和整改责任。
其次，审计局负责执行审计法规，参与起草地方性法规和政府规章，制定审计管理制度，并确保其执行。同时，制定审计工作计划，指导全市审计工作的发展和专业领域审计任务的实施。
审计局向市长报告年度预算执行情况，向市人大常委会提交审计工作报告，并公开审计结果。对特定事项如预算执行、财政转移支付、国有企业和金融机构等进行直接审计，出具审计报告并提出处理建议。
此外，审计局还对党政机关和企事业单位的经济责任进行审计监督，实施行业审计和专项审计调查，确保财经法规和宏观调控措施的有效执行，同时检查审计决定的执行情况，协助处理重大经济案件。
审计局指导内部审计工作，监督社会审计机构报告，并组织专业培训。对区级审计机关进行业务指导和监督，协同处理相关事务，包括区级审计机构的管理。
还负责审计市属企业在境外的资产、负债和损益，并推动信息技术在审计领域的应用，建设审计信息系统，完成上级交办的其他任务。
根据《中共武汉市委武汉市人民政府关于印发〈武汉市人民政府机构改革实施意见〉的通知》（武发〔2009〕14号）精神，设立武汉市审计局，为市人民政府工作部门。