1928年4月，福建省防军教导团成立，萧叔宣任团长。成为张贞的得力干将。
民国20年(1931)夏，为扩充实力提高职位，福建省政府决定，将福建省防军教导团扩编为福建省防军新的第2混成旅，萧叔宣改任旅长。
1932年5月，刚在松沪抗日战役中威震中外的国民革命军第十九路军奉调入闽。十九路军对福建其他各地方的军事势力先后加以整顿，以陈齐瑄接替萧叔宣充任旅长。
1933年夏，接替丘国珍任福建省团务处干部训练所所长。
1933年11月，十九路军发动福建事变。他受南京政府派遣，在闽发动民军反对十九路军。
民国23年(1934年)，因有留日背景，萧叔宣调任国民党政府驻日本首席中将武官。
七·七事变一年后，投靠汪伪，沦为汉奸，历任伪将校团教育长、伪军事委员会军训部部长、汪伪政府参议院院长、伪福建省政府主席、汪伪南京国民政府陆军部部长。
1943年11月25日，作为汪精卫的代表，萧叔宣与侵华日军总司令部第三科科长込政信大佐，飞往溪口，给蒋介石母亲王采玉扫墓，进行诱降。
1944年10月4日，福州第二次沦陷。按日方与南京汪伪政府的商议，将福州、厦门两地伪政权合并，成立伪省政府，由萧叔宣任伪省府主席。
1945年8月16日，长期潜伏在汪伪首都的军统南京站站长周镐，公开宣布成立国民政府军事委员会京沪行动总队南京指挥部，汪伪财政部警士队队长杨叔丹任行动处处长。
行动处在执行逮捕汉奸的过程中，周镐及张海帆、杨叔丹等17日上午去周佛海西流湾8号的家中商谈事宜，巧遇伪陆军部长萧叔宣。张海帆再次提出要抓萧。16日深夜，南京指挥部决定抓汉奸时，张海帆就企图借此报复，提出抓萧叔宣，被周镐决定缓一步再办，周镐此时因萧叔宣在周佛海家，逮捕不须费事，当即同意。在萧叔宣告别周佛海，乘轿车出周佛海官邸大门时，由杨叔丹执行逮捕萧的任务。当萧发现杨叔丹持枪拦车时，已预感到要出事，掏出手枪，被杨叔丹眼疾手快地抢先开了枪，打伤了腿部。当时萧叔宣血流如注，其随从三人也被缴了械，随后肖被杨叔丹等押送回新街口指挥部，丢弃在地下室的入户楼梯处。
周镐查问此事，知道是萧叔宣负伤，命人回指挥部时，发现肖已因失血而昏迷，立即送往白下路陆军医院抢救。结果萧叔宣因失血过多和枪弹(达姆弹)中毒而死。前后经过不到一小时。
