栀子主要病害是叶斑病和炭疽病，虫害主要有咖啡透翅天蛾、桃蛀螟及介壳虫等。
（1）叶斑病 主要发生在植株中、下部叶片上，病菌多在病落叶或病叶上越冬。次年随风雨传播侵染为害，多从植株下部开始发病。病斑不规则，褐色或中央淡褐色，具同心轮纹，发病严重的栀子叶片脱落，引起落果。防治方法：及时清除病落叶和病叶，铲除园中杂草，集中烧毁或深埋处理，以减少侵染源。5月下旬和8月上旬发病前，分别喷施50%甲基托布津1000倍液或1∶1∶100的波尔多液，每隔15天喷1次，连续2～3次。发病初期选用百菌清、多菌灵、甲基托布津、代森锌等各种杀菌药剂交替喷施防治。
（2）炭疽病 危害叶片和嫩果，病菌主要以菌丝体在病梢组织内越冬，第二年产生分生孢子借风雨和昆虫传播。一般5月开始发生，7～8月危害最严重，导致叶片呈褐色病斑坏死，果实裂开。通常危害不会很大，当果实成熟期高温多雨时发生较严重。防治方法：加强施肥和抚育等栽培管理，促进树势，增强抗病力；5～8月经常喷波尔多液保护和预防；多也叶斑病的防治相结合，发病时用退菌特、甲基托布津等高效低毒杀菌剂喷雾。
（3）咖啡透翅天蛾 一年发生多代，以蛹过冬，4月中下旬越冬蛹羽化为第一代成虫，雌虫产卵于叶上，每叶1～3粒，每雌虫平均产卵200余粒。危害高峰分别为6～7月和8～9月。3龄前幼虫取食嫩叶致麻点和孔洞，4龄后食量增大，暴食叶片，数量多时将整株叶片吃光，还蛀食枝条，可导致植株枯死。防治方法：冬季垦复，破坏咖啡透翅天蛾的蛹室，使蛹冻死；成虫期采用黑光灯诱蛾；掌握在幼龄阶段及时喷药防治，可选用20%杀灭菊酯乳油1500倍液，或80%敌敌畏2000倍液喷雾。
（4）栀子卷叶螟 幼虫取食幼嫩叶片、新芽、为害新梢顶端，稍卷叶，影响栀子夏梢、秋梢生长和花芽的形成，使次年产量下降。防治方法：在6～7月份抓住低龄幼虫阶段，喷施48%乐斯本乳油1500倍液，或10%吡虫啉可湿性粉剂2500倍液，或50%杀螟松乳油1500倍液等防治。
（5）桃蛀螟 一年发生3～4代，以老熟幼虫越冬，4月中旬至5月下旬第一代成虫出现；第二代6月中旬至7月中旬；第三代7月至8月中旬；第四代8月底到9月，少数可延续到10月中旬。成虫有趋光性，白天静伏在叶丛中，夜出活动。成虫产卵于栀子果实，幼虫蛀入果实内为害果肉，有转果蛀食习性。老熟幼虫在被害果内化蛹或由果内钻出，在果柄附近化蛹。防治方法：摘掉虫果，及时收集落果进行处理；在树干周围和枝、果上可喷撒白僵菌粉；严重时可喷施拟除虫菊酯类杀虫剂。
（6）龟蜡介壳虫 以若虫、雌虫为害枝梢和叶片。成虫被覆有白色或其他色泽分泌物，易于识别。主要吸食叶片汁液。受介壳虫危害后，易诱发烟煤病，影响光合作用，严重时造成枯枝落叶。防治方法：若虫期喷用40%速扑杀1000～1500倍液或25%蚧死净1500倍液防治；若虫期和雌虫期均可喷施1∶10松脂合剂防治。