证券公司、证券交易所、证券登记结算机构的区别如下：
1、概念不同
证券登记结算机构是指中国证券登记结算有限责任公司。从名称可知，其主要职责是对股份数量、流转情况进行登记及结算。证券交易所是为证券集中交易提供场所和设施，组织和监督证券交易，实行自律管理的法人。
证券公司是专门从事有价证券买卖的法人企业，分为证券经营公司和证券登记公司。是经主管机关批准并到有关工商行政管理局领取营业执照后专门经营证券业务的机构。它具有证券交易所的会员资格，可以承销发行、自营买卖或自营兼代理买卖证券。普通投资人的证券投资都要通过证券商来进行。
2、职能不同
证券公司，是由证券主管机关依法批准设立的在证券市场上经营证券业务的金融机构。其业务主要有代理证券发行；代理证券买卖或自营证券买卖：兼井与收购业务：研究及咨询服务；资产管理；其他服务。
证券交易所是证券买卖双方公开交易的场所，是一个有组织、有固定地点、集中进行证券交易的市场。证券交易所本身并不买卖证券，也不决定证券的价格，而是为证券交易提供一定的场所和设施，配备必要的管理和服务人员，并对证券交易进行周密的组织和严格的管理。
在我国，《证券法》指出"证券交易所是提供证券集中竞价交易场所的不以盈利为目的的法人"。我国内地目前有上海和深圳两大证券交易所。深市、沪市分别是深圳证券交易所和上海证券交易所的简称。
中国证券登记结算中心上属于中国证监会,主要负责证券账户和结算账户的设立和管理、证券和资金的清算与交收等。
3、特征不同
证券交易所具有以下特征：证券交易所一般都是依法设立的法人组织。根据我国证券法的规定，证券交易所的设立和解散，由国务院决定。证券交易所是集中竞价交易的场所。所谓集中竞价是指所有证券经纪商、自营商主要集中在这个场所通过竞争的方式，从事证券的代理或自营买卖活动。证券交易所是证券交易的组织者。
证券交易所是特殊法人。交易所在法律上具有独立的地位，但它自身不参与交易，除了提供服务充 当交易组织者的角色，还需执行法律法规赋予它的一线监管职能。
证券交易所和证券登记结算公司虽属两个单位，但是是一码事。证券登记结算公司就是以前从交易所分出来的。前者负责交易，后者负责结算。证券公司代理投资者向交易所传递交易指令，交易所负责成交，收盘后将交易数据转至结算公司，结算公司结算完在每天大概4点以后与证券公司进行交收，钱货正式易手。