口腔扁平苔藓的发病原因尚在医学研究的探讨中。目前，我们了解到该病的起因复杂，涉及多个方面。首先，精神因素被认为在其中扮演了角色，如长期的疲劳、高度的焦虑或紧张情绪可能会触发或加重病情。其次，免疫系统的反应也可能与疾病的发生相关，当免疫系统对某些刺激产生异常反应时，可能会导致扁平苔藓的发生。
内分泌系统的失调也被视为可能的发病因素，例如，某些激素水平的异常可能影响口腔黏膜的健康。此外，感染因素也不容忽视，可能与病原体感染有关，虽然具体的病原体尚未明确，但已知的感染可能通过影响机体的正常生理过程导致疾病发生。
微循环障碍，即血液在组织中的流动受阻，也可能与口腔扁平苔藓有关，这可能导致局部组织供氧不足，从而引发病变。微量元素的缺乏，特别是与口腔健康密切相关的那些，如锌、铁等，可能影响口腔黏膜的正常结构和功能。
最后，口腔扁平苔藓还可能与其他全身性疾病有关，如糖尿病、感染、高血压和消化道功能紊乱等。这些疾病可能通过影响全身健康，间接影响口腔黏膜的健康状况。然而，这些关联的具体机制仍在进一步研究中。
口腔扁平苔藓是一种常见的慢性口腔黏膜皮肤疾病，一般不具有传染性。该病的发病机制尚未完全明确，目前的研究表明，其发病与精神因素 （如疲劳、焦虑、紧张）、免疫因素、内分泌因素、感染因素、微循环障碍因素、微量元素缺乏以及某些全身疾病（糖尿病、感染、高血压、消化道功能紊乱）有关 。