南京大学好。
1、从历史发展来看，南京大学优于浙江大学。
解放前，南京大学是国立中央大学，由于受到政策的大力支持，学校实力强大，一时间国内无人能及，在亚洲也是排名靠前的大学。
在上个世纪80年代，南京大学的排名一度超过了北大清华，主要是学术成果方面，只是后来才小有下降。而浙大虽也是民国四大名校，若要和当年的中央大学比，显然不及。
2、从各自的发展史来看，南大更胜一筹。
1952年的院系调整，让南大元气大伤，从它里面分出去的院系各自如今都成了名校，有些还是985、211大学。这也就从另一个方面说明了南大的强大，如此拆分，至今仍是超一流名校。
3、从学科优势来看，南大相对优势明显。
从理工类的角度看，两校势均力敌，院士人数、重点实验室、重点学科都差不多，在此不做具体比较，比较都是在某些方面超过北大清华的。
不过从优势学科齐全的角度看，南京大学更好，它的中文系、历史系等都是相当厉害，这点浙大比不上。
浙江大学好。
在中国内陆校友会的大学排名中，浙江大学是排名在第四的位置，而南京大学排在第五位，浙江大学在综合实力方面还是要比南京大学略胜一筹的。
学科上来看，浙江大学的学科建设要好于南京大学。但是这并不代表南京大学有多差，它们都代表的中国教育的顶尖水平。只是可能术业有专攻，不同学校在不同的方面都有各自的建树。
浙江大学王牌学科简介：
浙江大学是双一流大学，还是百年名校，有很多的王牌专业，其中一级14个国家级重点学科分别是数学、化学、园艺学、机械工程、土木工程、电气工程、光学工程、生物医学工程、控制科学与工程、管理科学与工程、材料科学与工程、植物保护、农业资源利用、动力工程及工程热物理等。
此外，浙江大学设有博士后科研流动站，所涉及的学科更是覆盖面极广，包含了大部分的专业和学科，所以在浙江大学读书和学习还是一个不错的选择。
在所有浙江大学优势王牌专业里面，这些重点一级学科都是值得学的，前提是分数够的情况下。如果是男生的话，可以读工程类的专业，女生可以学园艺学、化学等，但是也要根据自己的兴趣爱好去选择，因为适合自己的才是最好的。
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