高级格式化，不重写MBR。一般我们重装系统时都是高级格式化， 所以有存在病毒的可能， 因为MBR不重写， MBR病毒可以通过杀毒软件，清除。或者。在DOS下，执行 fdisk /mbr 重写MBR 以彻底清除病毒。
格式化，简单说，就是把一张空白的盘划分成一个个小区域并编号，供计算机储存，读取数据。没有这个工作，计算机就不知在哪写，从哪读。
格式化这一概念原只应用于电脑硬盘，随着电子产品不断发展，很多存储器都用到了“格式化”这一名词，狭义的理解，就等于数据清零，删掉存储器内的所有数据，并将存储器恢复到初始状态。
硬盘必须先经过分区才能使用，磁盘经过分区之后，下一个步骤就是要对硬盘进行高级格式化（FORMAT）的工作，硬盘都必须格式化才能使用。
格式化是在磁盘中建立磁道和扇区，磁道和扇区建立好之后，电脑才可以使用磁盘来储存数据。
什么是格式化：这里我们用一个形象的比喻：假如硬盘是一间大的清水房，我们把它隔成三居室(分成三个区)；但是我们还不能马上入住，之前还必须对每个房间进行清洁和装修，那么这里的格式化就是“清洁和装修”这一步了！另外，硬盘使用前的高级格式化还能
识别硬盘磁道和扇区有无损伤，如果格式化过程畅通无阻，硬盘一般无大碍。
在Windows和DOS操作系统下，都有格式化Format的程序，不过，一旦进行格式化硬盘的工作，硬盘中的数据可是会全部不见喔！所以进行这个动作前，先确定磁盘中的数据是否还有需要，如果是的话先另行备份吧。
低级格式化:
低级格式化就是将空白的磁盘划分出柱面和磁道，再将磁道划分为若干个扇区，每个扇区又划分出标识部分ID、间隔区GAP和数据区DATA等。可见，低级格式化是高级格式化之前的一件工作，它只能够在DOS环境来完成。而且低级格式化只能针对一块硬盘而不能支持单独的某一个分区。每块硬盘在出厂时，已由硬盘生产商进行低级格式化，因此通常使用者无需再进行低级格式化操作。其实，我们对一张软盘进行的全面格式化就是一种低级格式化。
需要指出的是，低级格式化是一种损耗性操作，其对硬盘寿命有一定的负面影响。因此，许多硬盘厂商均建议用户不到万不得已，不可“妄”使此招。当硬盘受到外部强磁体、强磁场的影响，或因长期使用，硬盘盘片上由低级格式化划分出来的扇区格式磁性记录部分丢失，从而出现大量“坏扇区”时，可以通过低级格式化来重新划分“扇区”。但是前提是硬盘的盘片没有受到物理性划伤。
高级格式化就是清除硬盘上的数据、生成引导区信息、初始化FAT表、标注逻辑坏道等。
如果用对硬盘的C：区进行格式化键入格式如下：
[ ]内可填入参数，建议大家一般不要填加参数。
直接键入format C: ，然后回车就可以了，因为对一般人来说填加参数意义不大。
最主要、最常用的参数有以下几个。
/u 对硬盘进行破坏性格式化，如果不填加此参数，硬盘根目录下将产生一个隐藏的MIRROR映像文件，如果未进行其它硬盘操作，可以用UNFORMAT 恢复原来的硬盘内容，当然最好在格式化硬盘之前，将需要备份的数据等先备份好。
/s 格式化之后将DOS系统文件复制到硬盘根目录，填加此项参数，硬盘可以启动至C: 的状态，这在DOS时代非常有用，现在已经没有什么实际意义了。
/c 格式化硬盘的同时检查硬盘扇区并修复坏扇区，这种修复并不十分可靠，还会影响格式化的速度。
/v [label] 格式化后给硬盘加上[ ]内的卷标（名字）。
/q 快速格式化还有一些不常用的参数，就不一一介绍了。
我们仍需用WINDOWS98的启动盘，将其插入计算机的A驱动器，然后打开计算机，按1键，按回车，十几秒后屏幕将出现A: ，因为我们硬盘有3个分区，所以键入f: ，回车，屏幕变成F: （如果是2个分区就键入e: 回车，如果4个分区，就键入g: ，回车，以此类推）键入format c: 回车，出现下面提示。
WARNING , ALL DATA ON NON-REMOVABLE DISK
DRIVE C: WILL BE LOST!
Proceed with Format (Y/N)n
意思是说危险，C区数据将丢失，是否格式化？
我们按Y，回车，这时会出现一个进度数字指示，从1开始到99结束，格式化5G硬盘，如果计算机的配置高的化，2分钟左右可以结束，配置低则也可能要用5、6分钟，也许更慢些，但如果很长时间，进度数字不动的话，则硬盘有问题，需要更换或维修。
当进度数字闪过99后，出现下面的提示。
Volume label ( 11 characters , ENTER for none)?
意思是让我们给硬盘起个卷标，也就是名字，如果直接回车，则没有卷标名称。
然后会出现格式化完成后，硬盘空间的列表，会告诉我们硬盘的总容量，可用空间，系统占用空间，坏扇区占用空间，卷标，剩余空间等数据，并回到了F:/ 的状态，这说明我们已经成功的完成了格式化C分区的格式化，然后还按上面的步骤依次完成对D：区和E：区的格式化工作。
格式化：指对磁盘进行使用前的预处理以便存入数据。一般而言，新盘是必须格式化的，而使用过的旧盘也可以格式化，格式化后磁盘上全部数据将被删除。
注意：硬盘的格式化是一项非常危险的操作，建议提前备份重要数据，如果没有及时备份就格的用户可以在格式化（高级格式化）后用户可以用一些恢复软件来恢复重要数据，但是全区恢复的前提是没对格的分区写入任何内容。如果写进内容了，就可能不全部恢复了，但还是能恢复部分数据！
什么是格式化？
什么叫格式化？怎么格式化？
简单地说，格式化就是为磁盘做初始化的工作，以便我们能够按部就班地往磁盘上记录资料。好比我们有一所大房子要用来存放书籍，我们不会搬来书往屋里地上一扔了事，而是要先在里面支起书架，标上类别，把书分门别类地放好。
我们新购买的磁盘在使用之前，要能让操作系统认得它，要先写入一些磁性的记号到磁盘上的每一扇区，便可在该操作系统下取用磁盘上的数据，这个动作就称为格式化。
高级格式化和低级格式化
格式化动作可分为高级格式化(high-level format)和低级格式化(low-level format)两种。软盘只有高级格式化；而硬盘不仅有高级格式化，还有低级格式化的动作。低级格式化都是针对硬件的磁道为单位来工作，这个格式化动作是在硬盘分区和高级格式化之前做的，通常一般的使用者并不会去做这个动作。
若未特别指明，则一般格式化的动作所指的都是高级格式化。在MS-DOS操作系统当中，我们可以使用FORMAT指令来格式化硬盘与软盘，例如要格式化一片在磁盘驱动器A:当中的磁盘片，并将开机文件放入该磁盘当中，则使用‘FORMAT A: /S’指令，而在Windows操作系统中，格式化的动作则由‘资源管理器’来执行（右键点击磁盘名称-->“格式化……”）。
格式化的动作通常是在磁盘的开端写入启动扇区(boot sector)的数据、在根目录记录磁盘标签(volume label)、为文件分配表(FAT)保留一些空间，以及检查磁盘上是否有损坏的扇区，若有的话则在文件分配表标上损毁的记号（一般用大写字母“B”代表“BAD”），表示在该扇区并不用来储存数据。
注：在高级格式化之前，通常我们必须为磁盘驱动器指定分区(partition)，这是将一个实体磁盘驱动器分为数个分区，以使得不同的操作系统使用不同的分区，或是分为数台逻辑磁盘驱动器，这个动作称为“磁盘分区”。
快速格式化
在对磁盘进行格式化时，我们还有一个选择是“快速格式化”。
当运行常规格式化命令时，会在当前分区的文件分配表中将分区上的每一个扇区标记为空闲可用，同时系统将扫描硬盘以检查是否有坏扇区，扫描过程中会为每一个扇区打上可用标记。扫描坏扇区的工作占据了格式化磁盘分区的大部分时间。
如果选择的是快速格式化，那么将只从分区文件分配表中做删除标记，而不扫描磁盘以检查是否有坏扇区。只有在硬盘以前曾被格式化过并且在能确保硬盘没有损坏的情况下，才可以使用此选项。
数据安全性
理论上讲，高级格式化（不论是快速还是普通形式）并没有真正从磁盘上删除数据，它只是给数据所在的磁盘扇区的开头部分写入了一种特殊的删除标记，告诉系统这里可以写入新的数据。只要在格式化后没有立刻用全新的数据覆盖整个硬盘，那么原来的数据还会好端端在那里，只需要一些特定的软件即可恢复原来的数据。
相反地，低级格式化所做的是将磁盘上的每一个扇区用“00”覆盖，这将完全地破坏硬盘上的所有数据，不再有恢复的可能。
格式化能清除硬盘上的病毒么？
是的。只要针对某个分区的格式化命令被执行，这个分区上的一切现有数据就被标记为不可读。病毒作为一种程序文件自然也就看不到了，当然也就不可能再运行。
值得注意的是，一个硬盘往往不止一个分区，表现在“我的电脑”中，你会看到从C：开始的好几个盘符。你必须将所有这些不同盘符的分区格式化之后才能说自己的硬盘上百分百的没有病毒。否则的话，这个盘被格式化了，那个盘上还有病毒，什么时候打开别的盘来一读，病毒又会回来了。
在Windows环境下能格式化所有硬盘分区么？
答案是“不能”。只要Windows系统启动起来，在系统盘（一般是C：盘，也可自定义）上就有一些系统文件被锁定为不可移动或删除。Windows下的格式化命令是图形界面的Windows程序，这种程序是Windows操作系统的附属工具，离开Windows操作系统就无法运行，所以它不能格式化它的“上级”系统程序所在的磁盘分区。
只要不是系统分区，别的分区都可以轻松地对之进行格式化的操作。
怎样格式化所有硬盘分区？
答：想办法进入DOS，比如用Windows的启动光盘。进入DOS命令行界面后，使用 FORMAT X：（把X：换成任意字母+半角冒号,"X"必须是FAT格式分区）即可。也可用其他第三方磁盘管理工具比如PQ Magic等。这些磁盘分区软件，可以在分区的同时对当前分区进行格式化。
参考资料：http://zhidao.baidu.com/question/89840798.html