公司辞退怀孕女员工，女员工还可以主张以下赔偿：
1、生育津贴和生育医疗费用。如果公司依法为女员工缴纳了生育保险，这些费用由生育保险基金支付。如果公司未缴纳生育保险或违法终止劳动合同，导致女员工无法享受生育保险待遇，公司应按照女员工产假前的工资标准支付生育津贴和生育医疗费用。如果生育津贴低于女员工原工资水平，女员工有权要求公司补足差额。
2、孕期、产期、哺乳期的工资损失。这些期间的工资损失通常是指孕期、产假、哺乳期的工资损失。如果公司违法辞退，可能需要支付这些期间的工资损失。但具体能否得到支持，需要结合具体地方的法律和判例来确定。
怀孕期间被公司违法辞退后，可以按照以下流程申请仲裁：1. 提交申请书：当事人需要提交书面仲裁申请书，并按照被申请人数提交副本。2. 仲裁受理：仲裁委员会在收到仲裁申请后，应当在五日内作出受理或不予受理的决定。如果决定受理，应当在五日内将申诉书副本送达被申请人。如果决定不予受理，应当说明理由。3. 开庭审理：仲裁庭应当在开庭的五日前，将开庭日期、地点书面通知双方当事人。如果申请人无正当理由拒不到庭或者未经仲裁庭同意中途退庭，则按照撤诉处理；对被申请人可以做缺席裁决。4. 仲裁调解：仲裁庭处理劳动争议应当先行调解，在查明事实的基础上促使当事人双方自愿达成协议。如果调解达成协议，仲裁庭应当根据协议内容制作调解书，调解书自送达之日起具有法律效力；如果调解未达成协议，仲裁庭应当及时裁决。5. 仲裁裁决：仲裁庭裁决劳动争议案件，应当在劳动仲裁委员会受理仲裁申请之日起四十五日内结束。如果案情复杂需要延期，经批准可以延期并书面通知当事人，延长期限不超过十五日。仲裁庭裁决后应当制作仲裁书送达双方当事人。如果当事人对仲裁裁决不服，可以在收到裁决书之日起十五日内向人民法院起诉；期满不起诉的，裁决书即发生法律效力。
综上所述，公司辞退怀孕女员工需要支付相应的经济补偿，具体金额根据员工的工资、工作年限以及公司规章制度来确定。同时，公司应遵守劳动法规，尊重和保护孕期女员工的权益，员工也应及时维护自己的合法权益。
【法律依据】：
《中华人民共和国劳动法》
第二十九条
劳动者有下列情形之一的，用人单位不得依据本法第二十六条、第二十七条的规定解除劳动合同：
（一）患职业病或者因工负伤并被确认丧失或者部分丧失劳动能力的；
（二）患病或者负伤，在规定的医疗期内的；
（三）女职工在孕期、产期、哺乳期内的；
（四）法律、行政法规规定的其他情形。
《中华人民共和国劳动合同法》
第四十二条
劳动者有下列情形之一的，用人单位不得依照本法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同：
（一）从事接触职业病危害作业的劳动者未进行离岗前职业健康检查，或者疑似职业病病人在诊断或者医学观察期间的；
（二）在本单位患职业病或者因工负伤并被确认丧失或者部分丧失劳动能力的；
（三）患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内的；
（四）女职工在孕期、产期、哺乳期的；
（五）在本单位连续工作满十五年，且距法定退休年龄不足五年的；
（六）法律、行政法规规定的其他情形。
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