嫁接时，砧木和接穗上都要造成伤口，伤口表面部分细胞变褐死亡，这些死细胞的残留物形成一层褐色隔膜，封闭和保护伤口。此后在创伤激素的作用下，砧穗双方伤口周围细胞和形成层细胞开始分裂，形成愈伤组织，并使隔膜破裂。随着双方愈伤组织的不断生长，砧木和接穗的愈伤组织细胞将砧木和接穗间的空隙填满，将砧木与接穗的形成层连接起来。此后，连接起的形成层逐渐分化，向内分化新的木质部，向外分化新的韧皮部，砧穗双方木质部导管和韧皮部筛管连通。愈伤组织外部细胞分化成新的周皮，与砧穗周皮相连，达到全面愈合（图1-13）。
枝接嫁接愈合过程示意图
愈伤组织产生的速度及连接的快慢受多种因素影响，砧木和接穗本身的特性和质量是主要的内在因素，外在影响因素有隔膜的厚薄、砧穗削面平滑程度、绑缚的松紧、温度和湿度等。