北京航空航天大学有60多个本科专业。最好的专业，电子信息工程、通信工程、软件工程、飞行器设计与工程、飞行器动力工程、数学与应用数学、机械工程及自动化、材料科学与工程、电气工程及其自动化、测控技术与仪器、探测制导与控制技术，这些专业都是国家级特色专业。
(1) 材料科学与工程系，有一个专业类：材料科学与工程类，含金属材料、电子信息材料、金属腐蚀与防护，高分子与复合材料，材料加工五个专业方向。
(2) 电子信息工程系，有1个专业类：无线电工程类，含微波技术与天线、导航、雷达、遥控遥测4个专业。
(3) 自动控制系，有2个专业类：航空自动控制类，含飞行器自动控制、航空陀螺与惯性导航、航空电器工程、航空仪表与测试4个专业；流体控制与操纵系统类，含流体控制与操纵系统1个专业。?
(4) 发动机系，有1个专业类：发动机设计类，含航空涡轮喷气发动机、固体火箭发动机2个专业。?
(5) 飞行器设计与应用力学系，有2个专业类：飞行器设计类，含飞机设计、有翼导弹设计、高空设备3个专业；航空工程力学类，含固体力学、空气动力学、飞行力学3个专业。
(6) 计算机科学与工程系，有1个专业类：计算机科学与工程类，含电子计算机、计算机 软件2个专业。
(7) 机械制造工程系，有1个专业类：航空制造工程类，含航空焊接工程、飞行器制造工程、机械加工工程、机械制造自动控制工程4个专业。
(8) 生物工程系；现有生物工程本科专业和生物医学工程一级学科硕、博士点，拥有生物医学工程博士后流动站。