可以抵扣的发票种类包括：增值税专用发票、普通发票中的电子普通发票以及符合规定的农产品收购发票。
增值税专用发票是增值税税制下的一种重要发票类型，接受该发票的企业可以按照规定进行税额抵扣。这种发票的使用范围较广，涉及多个行业和领域。只要是合法取得，并且通过税务部门认证，就可以作为企业增值税进项税额进行抵扣。
普通发票中的电子普通发票也允许进行抵扣。这种发票的出现是为了适应电子商务发展的需要，随着电子商务的兴起而得到广泛应用。符合条件的电子普通发票，其开具的增值税税额同样可以参与抵扣。
符合规定的农产品收购发票也可以进行抵扣。企业在收购农产品时，开具的农产品收购发票若是符合税务部门的相关规定，其上面所列的税额也可以作为进项税额进行抵扣。这有助于鼓励农业产业的发展，并降低企业的成本。
以上几种发票的抵扣操作都需要严格按照税务部门的规定进行，企业需要确保所取得的发票真实、合法，并且经过税务部门的认证。在操作过程中，企业还需注意防范发票欺诈等风险，确保税务工作的合规性。