长期的城乡二元发展格局导致城乡在科技、人才、资金及土地等要素配置方面存在严重的不均衡，对城乡协调发展产生了极大的阻碍。
一、城乡科技配置不均衡
长期的城乡二元发展格局导致农村地区的科技投入严重不足，科技创新能力较弱。相比之下，城市地区由于集中了大量的科研机构和高校，科技资源相对丰富，创新能力较强。这种不均衡配置使得农村地区的农业现代化进程缓慢，难以适应现代化发展的需要。
二、城乡人才流动不畅通
城乡二元发展格局也导致人才在城乡之间的流动不畅通。农村地区由于经济发展水平相对较低，难以吸引和留住高素质人才。而城市地区由于经济发展较快，吸引了大量的人才涌入。这种人才流动的不均衡使得农村地区在人才资源方面更加匮乏，进一步加剧了城乡发展差距。
三、城乡资金配置不合理
在资金配置方面，城乡二元发展格局也导致了明显的不均衡。农村地区由于经济发展滞后，资金来源有限，难以支撑大规模的基础设施建设和产业发展。而城市地区则相对容易获得资金支持，从而推动了经济的快速发展。这种资金配置的不合理使得城乡之间的差距进一步拉大。
四、城乡土地资源配置不当
土地是城乡发展的基础要素之一，但长期的城乡二元发展格局导致土地资源配置不当。农村地区往往存在大量的闲置土地和低效利用土地，而城市地区则面临土地资源紧张的问题。这种土地资源配置的不当使得城乡之间的土地利用效率存在显著差异，也制约了城乡的协调发展。
综上所述：
长期的城乡二元发展格局导致城乡在科技、人才、资金及土地等要素配置方面存在严重的不均衡，这种不均衡不仅影响了农村地区的经济社会发展，也制约了城市地区的可持续发展。为了推动城乡协调发展，需要加大农村地区的科技投入，促进人才流动，优化资金配置，以及合理利用土地资源。
法律依据：
《中华人民共和国宪法》
第十四条规定：
国家通过提高劳动者的积极性和技术水平，推广先进的科学技术，完善经济管理体制和企业经营管理制度，实行各种形式的社会主义责任制，改进劳动组织，以不断提高劳动生产率和经济效益，发展社会生产力。国家厉行节约，反对浪费。
国家合理安排积累和消费，兼顾国家、集体和个人的利益，在发展生产的基础上，逐步改善人民的物质生活和文化生活。
国家建立健全同经济发展水平相适应的社会保障制度。
《中华人民共和国乡村振兴促进法》
第四条规定：
全面实施乡村振兴战略，促进农业全面升级、农村全面进步、农民全面发展，加快农业农村现代化，全面建设社会主义现代化国家。
国家建立健全城乡融合发展体制机制和政策体系，促进城乡协调发展、共同繁荣。
国家采取措施，优先支持农业农村发展，加快补齐农业农村短板，促进农业高质高效、乡村宜居宜业、农民富裕富足。
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