南京中医药大学不是985大学也不是211院校，但却是一所双一流大学。该大学创建于1954年，是国家“双一流”建设高校、江苏高水平大学建设高校（A类），同时也是教育部、江苏省人民政府与国家中医药管理局的共建高校。
南京中医药大学是全国建校最早的高等中医药院校之一，被誉为“高等中医教育的摇篮”。该校在新中国高等中医药教育方面做出了开创性的贡献，为新中国高等中医药教育模式的确立和推广提供了帮助。
该校拥有1个国家“双一流”建设学科，3个国家重点学科，2个国家重点（培育）学科，4个江苏高校优势学科，以及8个“十四五”省重点学科。此外，学校还拥有33个国家中医药管理局中医药重点学科。
南京中医药大学是全国首批博士学位和硕士学位授予单位，拥有4个一级学科博士学位授权点、1个博士专业学位授权点、12个一级学科硕士学位授权点和6个硕士专业学位授权点。此外，该校还有3个博士后科研流动站。