（一）荧光色素 许多物质都可产生荧光现象,但并非都可用作荧光色素.只有那些能产生明显的荧光并能作为染料使用的有机化合物才能称为免疫荧光色素或荧光染料.常用的荧光色素有：
异硫氰酸荧光素
2.四乙基罗丹明
3.四甲基异硫氰酸罗丹明
4.藻红蛋白
（二）其他荧光物质
1.酶作用后产生荧光的物质：某些化合物本身无荧光效应,一旦经酶作用便形成具有强荧光的物质.例如4-甲基伞酮-β-D半乳糖苷,受β-半乳糖苷酶的作用分解成4-甲基伞酮,后者可发出荧光,激发光波长为360nm,发射光波长为450nm.其他如碱性磷酸酶的底物4-甲基伞酮磷酸盐和辣根过氧化物酶的底物对羟基苯乙酸等.