汇算清缴需要填写的表格主要包括：企业所得税年度纳税申报表（主表及附表）、财务报表、关联业务往来报告表等。
具体填写方法如下：
首先，填写企业所得税年度纳税申报表。这个表格需要提供企业的基本信息、收入情况、成本费用、纳税调整、应纳税所得额和应纳税额等数据。在填写时，需要根据企业的实际情况，逐项填写，并核对各项数据的准确性。同时，还需要注意填报附表中的相关指标，如资产折旧、摊销情况，税前弥补亏损等。
其次，填写财务报表。财务报表包括资产负债表、利润表和现金流量表等，是反映企业财务状况和经营成果的重要工具。在填写时，需要根据企业会计准则的规定，编制准确的财务报表，并对其进行审核和调整。同时，还需要注意财务报表与纳税申报表之间的数据一致性。
最后，填写关联业务往来报告表。如果企业与关联方之间发生了业务往来，需要填报关联业务往来报告表，以披露关联方信息、关联交易情况等。在填写时，需要根据税法规定和实际情况，逐项填写，并保证数据的真实性和准确性。
需要注意的是，不同地区的税务机关对汇算清缴的具体要求可能会有所不同，因此企业在填报时需要结合当地税务机关的要求进行具体操作。同时，企业在填报过程中遇到任何问题，都可以向税务机关咨询或请教专业人士的帮助。