windows/system32/config/system的损坏或丢失的原因：电脑的初始化文件遭破坏所致。导致破坏的原因也可能是病毒或其他原因。
由于Windows启动需要读取Syatem.ini,Win.ini和注册表文件，如果C盘根目录下有config.sys,Autoexec.bat 文件，这两个文件也会被读取。只要这些文件存在错误信息就可能出现死机。
因windows/system32/config/system的损坏或丢失解决方法：
1，这个问题多半是由于内存条质量原因引起，请先检查与更换内存测试。
2，硬盘坏道，请修复。
3，以上都不是的话，请用以下方法：
当XP启动不起来并提示以下文件损坏或丢失windows无法启动WINDOWS/system32/config/system 需要光盘启动按"r"修复时，采用这种办法 前提是必须能重启到DOS下，如果系统是NTFS的话，那还要DOS支持才行；请用相关启动光盘或MaxDOS启动到DOS下 先到windows/repair目录里 然后copy system c:/windows/system32/config/system 这样就可以重启到桌面了。但这样以前的设置就全没了，这是恢复到第一次启动到桌面时的配置，还要重新安装你的驱动和设置。
如何是用windows 2000系统也出现这个提示:C:/winnt/system32/config/system 或者c:/winnt/system32/drivers/ntfs.sys文件丢失,方法也是可以用2000的系统安装光盘进入安装界面按R键进行修复.。
用系统安装盘启动系统，按“R”键选择修复或恢复选项，进入故障恢复控制台。系统会自动检测安装的操作系统，输入数字1选择需要修复的操作系统，按要求键入本地管理员账户Administrator的密码即可进入DOS控制台界面。
依次键入如下命令行：
md tmp copy c:/windows/system32/config/system c:/windows/tmp/system.bak copy c:/windows/system32/config/software c:/windows/tmp/software.bak copy c:/windows/system32/configm c:/windows/tmpm.bak copy c:/windows/system32/configcurity c:/windows/tmpcurity.bak copy c:/windows/system32/config/default c:/windows/tmp/default.bak delete c:/windows/system32/config/system delete c:/windows/system32/config/software delete c:/windows/system32/configm delete c:/windows/system32/configcurity delete c:/windows/system32/config/default
(注：下面的步骤即是将windows/repair目录中存放的最原始的系统信息文件还原道系统目录中。)
copy c:/windows/repair/system c:/windows/system32/config/system copy c:/windows/repair/software c:/windows/system32/config/software copy c:/windows/repairm c:/windows/system32/configm copy c:/windows/repaircurity c:/windows/system32/configcurity copy c:/windows/repair/default c:/windows/system32/config/default
所有文件都copy完毕的话，键入exit命令重新启动即可。
此外，如果遇到某些不知名的系统启动文件损坏时，也可以通过故障恢复控制台来修复。一般来说，进入故障恢复控制台后键入“Fixboot”命令将新的分区引导扇区写到系统分区中，很多情况下可以解决系统无法正常启动的问题。