甘肃省财政厅设20个内设机构：
（一）办公室。
负责协调机关日常工作；承担有关重要会议的组织、有关重要报告和文件的起草；承担财政信息、宣传、新闻发布、政府信息公开工作；负责文电、机要、信访、安全保密、档案和机关财务、资产管理等工作；负责重要工作的督查督办。
（二）综合处（条法处）。
分析预测宏观经济形势并提出政策建议；拟订收入分配政策和改革方案；管理住房改革预算资金；会同有关方面拟订土地、矿产等国有资源收入政策；拟订全省政府非税收入政策，并监督检查政策落实；审批行政事业性收费项目，参与标准核定；承担彩票管理的有关工作；组织协调财政法规草案的拟订，审核其他法规草案中有关财政税收的条款；承担机关规范性文件的合法性审核及备案工作；承担财政部门行政复议、行政应诉和国家赔偿费用管理工作。
（三）税政处。
贯彻落实国家税收政策，组织实施税制改革政策；行使赋予地方的税收管理职能，拟订相关税收政策调整建议；组织开展税源调查和重点产品国际竞争力调查，拟订调整我省企业关税税目、税率的意见建议；承办我省企业提出的税收减免、退库、出口退税建议；承担省农村综合改革领导小组办公室的具体工作。
（四）预算处。
拟订全省财政政策、财政体制、预算管理制度和中长期财政规划建议；编制年度省级预决算草案，办理预算追加事宜；汇总年度全省财政预算；负责省级部门预算审批、调整工作；承担省级部门支出标准体系建设及项目库管理工作；研究建立财政支出绩效评价制度和评价体系；负责省对市县的转移支付工作，指导市县财政预算管理和改革工作；拟订全省政府性债务管理制度和办法。
（五）市县财政管理处。
参与拟订省以下财政管理体制意见建议；负责省对市州及直管县财政管理体制改革的具体工作，指导市县完善对下的财政管理体制；审核、汇总市县年度预算；参与办理省对市县年度决算、结算及全省决算汇审工作；监督检查省级下达市县各类专项补助，一般性转移支付资金的分配、管理使用，以及主要政策的落实情况，组织进行绩效评价；指导市县地方政府性债务管理工作。
（六）国库处。
负责财政预算执行及分析预测；制定财政国库管理制度；负责财政国库集中收付制度改革；调度拨付财政资金；统一管理财政和预算单位银行账户；承担政府会计管理及总会计核算工作；组织编审财政总决算和部门决算；负责财政国库信息化建设；指导和监督国家金库甘肃分库业务；承担地方国库现金管理工作；负责管理政府债券发行、兑付、核算相关工作。
（七）省非税收入征收管理处。
拟订全省非税收入征收管理制度和实施办法；负责省本级非税收入的征收管理，并将资金及时解缴国库或财政专户；组织实施全省非税收入收缴管理改革、征收管理系统建设；管理全省财政票据；开展非税收入日常监督和专项稽查；承担全省非税收入统计和综合分析工作；指导全省非税收入征收管理工作。
（八）政府采购办公室。
贯彻执行国家有关政府采购的法律法规和方针政策，负责拟订和执行全省政府采购规章制度，监督管理全省政府采购工作；负责拟订全省政府采购目录；承担全省政府采购信息发布、统计评价工作；承担省级政府采购资金结算工作；承担省级政府采购专家库的建立、管理工作；指导全省政府采购工作。
（九）行政政法处。
负责分管单位的部门预算有关工作；拟订行政性经费财务管理制度；参与拟订分管单位行业发展规划和相关政策、制度；制定省级一般性支出开支标准和定额；承担党政、政法机关经费保障工作；对专项资金进行追踪问效，监督项目实施中资金的管理使用和配套到位情况，进行项目完成后的效益考核；审核分管单位的年度财务决算。
（十）教科文处。
负责分管单位的部门预算有关工作，研究提出相关财政政策；组织执行事业单位财务管理规则，拟订有关教科文事业财务管理制度；参与拟订分管单位行业发展规划和相关政策、制度；承担义务教育经费保障机制改革的具体工作；承担省级国有文化企业财务管理有关工作；对专项资金进行追踪问效，监督项目实施中资金的管理使用和配套到位情况，进行项目完成后的效益考核；审核分管单位的年度财务决算。
（十一）经济建设处。
负责分管单位的部门预算有关工作；参与拟订分管单位行业发展规划和相关政策、制度；拟订有关专项资金使用管理办法；管理省级预算内基本建设、地方债券等投资；承担有关政策性补贴和专项储备资金财政财务管理工作；对专项资金进行追踪问效，监督项目实施中资金的管理使用和配套到位情况，进行项目完成后的效益考核；审核分管单位的年度财务决算；承担财政投资评审管理工作。
（十二）农业处。
负责分管单位的部门预算有关工作，研究提出相关财政政策；参与拟订分管单位行业发展规划和相关政策、制度；拟订全省财政支农资金管理有关制度和办法，管理支农专项资金、财政扶贫资金和政策性农业和扶贫专项贷款贴息；对专项资金进行追踪问效，监督项目实施中资金的管理使用和配套到位情况，进行项目完成后的效益考核；审核分管单位的年度财务决算。
（十三）社会保障处。
负责分管单位的部门预算有关工作，拟订相关财政政策；参与拟订分管单位行业发展规划和相关政策、制度；编制省级社会保障预决算草案；审核全省社会保险基金预决算草案；管理财政社会保障和就业及医疗卫生支出；拟订有关资金（基金）财务管理办法；承担社会保险基金财政监管工作；对专项资金进行追踪问效，监督项目实施中资金的管理使用和配套到位情况，进行项目完成后的效益考核；审核分管单位的年度财务决算。
（十四）企业处（地方金融处）。
负责分管单位的部门预算有关工作；贯彻落实支持国有企业改革发展的财政政策；组织实施《企业财务通则》等财务制度；参与拟订分管单位行业发展规划和相关政策、制度；负责省本级和指导地方开展国有资本经营预算工作；承担全省企业财务信息管理工作；承担资产评估事务所及其分支机构的设立、合并、终止的审批及管理工作；负责省属金融机构国有资产与财务监管，参与省属金融机构改制工作；对专项资金进行追踪问效，监督项目实施中资金的管理使用和配套到位情况，进行项目完成后的效益考核；审核分管单位的年度财务决算。
（十五）行政事业单位国有资产管理处。
拟订全省行政事业单位国有资产管理办法及省级行政事业单位国有资产管理配套制度和办法；拟订全省行政事业单位国有资产配置标准，编审省级行政事业单位国有资产配置预决算；承担配置、处置、调剂、出租、出借以及利用国有资产对外投资、担保等事项的审批工作；承担与行政单位尚未脱钩经济实体、事业单位创办的具有法人资格企业等的国有资产监管工作。
（十六）国际处。
负责全省国际金融组织和外国政府贷（赠）款业务；审批和管理省级外事经费、偿债资金、还贷准备金等专项资金及非贸易外汇；会同有关部门承担全省财政对外交流与合作以及与国外贷款项目有关的出国（境）学习培训工作。
（十七）信息管理处。
制定全省财政信息化建设规划和预算；制定财政信息化建设实施规范、技术标准和管理制度；承担财政业务专网、应用系统和办公自动化系统建设管理工作；承担财政网络系统安全和保密管理工作；编制信息化专项资金使用计划，监督资金使用；制定信息技术培训计划。
（十八）会计处。
组织实施会计准则制度、内部控制规范；管理全省会计从业资格；承担高级会计师评审及会计专业技术资格考试、会计人员继续教育管理工作；承担会计师事务所及其分支机构的设立、合并、终止的审批及管理工作；组织实施会计信息化标准。
（十九）财政监督检查局。
拟订财政监督检查政策和制度；监督财税法规、政策执行，检查反映财政收支管理中的重大问题，提出加强财政管理的政策建议；监督检查会计信息质量、注册会计师及会计师事务所执业质量，依法查处违法行为；指导全省财政监督检查工作。
（二十）人事处。
负责厅机关、直属及归口管理单位机构编制、人事管理和因公因私出国出境政审工作；承担厅机关和直属及归口管理单位干部职工队伍建设工作；牵头负责厅系统离任审计工作；制定并组织实施财政系统教育培训规划，指导各地财政教育培训工作；会同有关部门开展内部监督工作；负责厅机关、直属单位离退休干部职工工作。
