土壤中的污染物质一般指影响土壤正常作用的外来物质。这些物质会改变土壤的主要成分，影响树体的生长与果品质量。当有害物质通过果品进入人体后，就会影响人体的健康。土壤中的污染物主要通过大气污染、水体污染和作为生产投入物而进入土壤。一般来说，当土壤中的有害物质含量达到一定的数量值时，就会被植物吸收而积累到树体中，在果实中累积，进而危害人体的健康。造成土壤污染的污染物质，主要有以下几类。
（1）有机物类
污染土壤的有机物主要是有机化学农药和
除草剂等，如有机氯农药六六六、SST和艾氏剂等；有机磷农药如对硫磷和
马拉硫磷等；氨基甲酸酯农药或除草剂；苯氧羧酸类除草剂，如2，4-D；2，4，5-T等，在土壤中难以分解、残留时间较长的农药或除草剂，均可形成对土壤的污染。
工业中的“三废”，也有许多有机污染物，如酚、油脂、多氯连苯和
苯并芘等，也易于进入土壤并长期积累而成为有机污染物。在生活污水中常用的洗涤剂、塑料、粪便及油脂等，也会成为土壤中的有机污染物。
（2）重金属类
造成土壤污染的重金属有汞、镉、铅、铜、锰、锌、镍，还有砷等，由于这些物质在土壤中不易被微生物分解，长期积累后，则很难彻底消除。重金属污染土壤主要是通过含有重金属的污水灌溉，含有重金属的粉尘降落到土壤上，含有重金属的工业废渣的肥料施用和施用含有重金属的农药制剂等引起。
（3）放射性物质
污染土壤的放射性物质主要是指
核爆炸后降落的污染物，如
原子能所排出的液体、气体中的废弃物，通过自然降落、雨水冲刷与废弃物的堆积而污染土壤等。
（4）化学肥料
在生产上大量使用含氮、磷的化学肥料，造成土壤中积累过盛，导致土壤污染。特别是大量施用铵态氮肥，
铵离子能够置换出土壤胶体上的
钙离子，造成土壤颗粒分散，从而破坏土壤的团粒结构。
硫酸铵、氯化铵等生理酸性肥料使用过多会导致土壤微生物的区系改变，促使土壤中病原菌数量增多。同时磷肥亦是土壤中有害重金属的一个重要污染源，磷肥中含铬量较高，过磷酸钙中含有大量的镉、砷、铅，磷矿石中还有放射性污染，如铀、镭等。过量使用钾肥会使土壤板结，并降低土壤pH，从而影响植物生长。
氯化钾中氯离子对果实及其他农作物的产量和品质均有不良影响。
（5）致病微生物
在人畜粪便、生活污水及医院垃圾中含有大量的病原微生物，当人体接触被这些污染的土壤后会感染上各种细菌和病毒；若食用被污染土壤所生产的果品时，则会威胁到人体的健康。因此，在靠近医院、蓄禽养殖场及使用城镇污水灌溉的果园，应特别注意水源是否被污染。