焉耆回族自治县的行政区划包含了多个行政单位，其中包括4个镇和4个乡。这些镇分别是焉耆镇、七个星镇、永宁镇和四十里城子镇，每个镇都有其独特的行政编码和下属的社区或村委会。例如，焉耆镇的代码为652826100，下辖10个社区和1个村委会，如新华路社区、上四号渠村等。
七个星镇的代码为652826101，有1个社区和9个村委会，如幸福路社区、哈尔莫墩村等。永宁镇的代码为652826102，设有2个社区和8个村，如永兴路社区、下岔河村等。四十里城子镇的代码为652826103，包含1个社区和5个村庄，如新城路社区、阿克墩村等。
在乡级行政区划中，北大渠乡、五号渠乡、包尔海乡和查汗采开乡分别对应着6个、1个社区和8个或4个村委会，如北大渠乡的北大渠村、五号渠乡的头号渠村等。此外，还有王家庄牧场、苏海良种场和兵团二十七团等特定的农业区域，它们在县的行政区划中也占据一席之地。
焉耆回族自治县位于新疆维吾尔自治区中部，天山中段焉耆盆地中央。东南与博湖县毗邻，北与和静县接壤，东北与和硕县相连，南与库尔勒市相望，西南与轮台县为界。总面积2429.32平方千米，总人口12万人（2004年）。有回、汉、维、蒙等23个民族。